Publications of the Department's members

» 2023

  1. BacSp222 bacteriocin as a novel ligand for TLR2/TLR6 heterodimer (2023) Śmiałek-Bartyzel, J., Bzowska, M., Mężyk-Kopeć, R., Kwissa, M., & Mak, P. Inflammation Research 72(5), 915–928.
  2. Candida albicans Biofilm-Derived Extracellular Vesicles Are Involved in the Tolerance to Caspofungin, Biofilm Detachment, and Fungal Proteolytic Activity (2023) Karkowska-Kuleta, J., Kulig, K., Bras, G., Stelmaszczyk, K., Surowiec, M., Kozik, A., Karnas, E., Barczyk-Woznicka, O., Zuba-Surma, E., Pyza, E., & Rapala-Kozik, M. Journal of Fungi (Basel, Switzerland), 9(11), 1078.
  3. Candida parapsilosis cell wall proteins-CPAR2_404800 and CPAR2_404780-Are adhesins that bind to human epithelial and endothelial cells and extracellular matrix proteins (2023) Satala, D., Karkowska-Kuleta, J., Bras, G., Rapala-Kozik, M., & Kozik, A. Yeast, 40(8), 377–389.
  4. Cecropin D-derived synthetic peptides in the fight against Candida albicans cell filamentation and biofilm formation (2023) Guevara-Lora, I., Bras, G., Juszczak, M., Karkowska-Kuleta, J., Gorecki, A., Manrique-Moreno, M., Dymek, J., Pyza, E., Kozik, A., & Rapala-Kozik, M. Frontiers in Microbiology, 13, 1045984.
  5. Crystal Structure of Staphopain C from Staphylococcus aureus (2023) Magoch, M., McEwen, A. G., Napolitano, V., Władyka, B., & Dubin, G. Molecules (Basel, Switzerland), 28(11), 4407.
  6. Defence response of Galleria mellonella larvae to oral and intrahemocelic infection with Pseudomonasentomophila (2023) Kordaczuk, J., Sułek, M., Mak, P., Śmiałek-Bartyzel, J., Hułas-Stasiak, M., & Wojda, I. Developmental and Comparative Immunology 147, 104749.
  7. In Silico and In Vitro Assessment of Carbonyl Reductase 1 Inhibition Using ASP9521-A Potent Aldo-Keto Reductase 1C3 Inhibitor with the Potential to Support Anticancer Therapy Using Anthracycline Antibiotics (2023) Jamrozik, M., Piska, K., Bucki, A., Koczurkiewicz-Adamczyk, P., Sapa, M., Władyka, B., Pękala, E., & Kołaczkowski, M. Molecules (Basel, Switzerland), 28(9), 3767.
  8. Isolation and Characteristics of Extracellular Vesicles Produced by Probiotics: Yeast Saccharomyces boulardii CNCM I-745 and Bacterium Streptococcus salivarius K12 (2023) Kulig, K., Kowalik, K., Surowiec, M., Karnas, E., Barczyk-Woznicka, O., Zuba-Surma, E., Pyza, E., Kozik, A., Rapala-Kozik, M., & Karkowska-Kuleta, J. Probiotics and Antimicrobial Proteins, 10.1007/s12602-023-10085-3.
  9. Living together: The role of Candida albicans in the formation of polymicrobial biofilms in the oral cavity (2023) Rapala-Kozik, M., Surowiec, M., Juszczak, M., Wronowska, E., Kulig, K., Bednarek, A., Gonzalez-Gonzalez, M., Karkowska-Kuleta, J., Zawrotniak, M., Satała, D., & Kozik, A. Yeast 40(8), 303–317.
  10. Membrane-Active Peptide with Antitumoral Potential against Human Skin Cancer Cells (2023) Fandiño-Devia, E., Santa-González, G. A., Klaiss-Luna, M. C., Guevara-Lora, I., Tamayo, V., & Manrique-Moreno, M. Membranes, 13(7), 671.
  11. More than Just Protein Degradation: The Regulatory Roles and Moonlighting Functions of Extracellular Proteases Produced by Fungi Pathogenic for Humans (2023) Satala, D., Bras, G., Kozik, A., Rapala-Kozik, M., & Karkowska-Kuleta, J. Journal of Fungi (Basel, Switzerland), 9(1), 121.
  12. The Recruitment and Activation of Plasminogen by Bacteria-The Involvement in Chronic Infection Development (2023) Satala, D., Bednarek, A., Kozik, A., Rapala-Kozik, M., & Karkowska-Kuleta, J. International Journal of Molecular Sciences, 24(13), 10436.

» 2022

  1. The effect of bradykinin on the pro-inflammatory response of human adipocytes. Guevara-Lora I, Sordyl M, Niewiarowska-Sendo A, Bras G, Korbut E, Goralska J, Malczewska-Malec M, Solnica B, Kozik A. Acta Biochim Pol. 2022, 69, 495-505. DOI: 10.18388/abp.2020_6389.
  2. Secondary (Late) Developmental Dysplasia of the Hip with Displacement: From Case Studies to a Proposition for a Modified Diagnostic Path. Dygut J, Sułko J, Guevara-Lora I, Piwowar M. Diagnostics (Basel) 2022, 12, 1472. DOI: 10.3390/diagnostics12061472.
  3. Efficient Adsorption of Chromium Ions from Aqueous Solutions by Plant-Derived Silica. Guevara-Lora I, Wronski N, Bialas A, Osip H, Czosnek C. Molecules. 2022, 27, 4171. DOI: 10.3390/molecules27134171.
  4. Insight Into the Properties and Immunoregulatory Effect of Extracellular Vesicles Produced by Candida glabrata, Candida parapsilosis, and Candida tropicalis Biofilms. Kulig K, Karnas E, Woznicka O, Kuleta P, Zuba-Surma E, Pyza E, Osyczka A, Kozik A, Rapala-Kozik M, Karkowska-Kuleta J. Front Cell Infect Microbiol. 2022, 12, 879237. DOI: 10.3389/fcimb.2022.879237.
  5. Bacteriocin BacSp222 and Its Succinylated Forms Exhibit Proinflammatory Activities Toward Innate Immune Cells . Śmiałek J, Bzowska M, Hinz A, Mężyk-Kopeć R, Sołtys K, Mak P. J Inflamm Res. 2022 , 15, 4601-4621. DOI: 10.2147/JIR.S362066.
  6. Cationic protein 8 plays multiple roles in Galleria mellonella immunity. Kordaczuk J, Sułek M, Mak P, Zdybicka-Barabas A, Śmiałek J, Wojda I. Sci Rep. 2022, 12, 11737. DOI: 10.1038/s41598-022-15929-6.
  7. Cinnamamide derivatives with 4-hydroxypiperidine moiety enhance effect of doxorubicin to cancer cells and protect cardiomyocytes against drug-induced toxicity through CBR1 inhibition mechanism. Koczurkiewicz-Adamczyk P, Gąsiorkiewicz B, Piska K, Gunia-Krzyżak A, Jamrozik M, Bucki A, Słoczyńska K, Bojdo P, Wójcik-Pszczoła K, Władyka B, Kołaczkowski M, Pękala E. Life Sci. 2022, 305, 120777. DOI: 10.1016/j.lfs.2022.120777.
  8. Staphylococcal saoABC Operon Codes for a DNA-Binding Protein SaoC Implicated in the Response to Nutrient Deficit. Bukowski M, Kosecka-Strojek M, Madry A, Zagorski-Przybylo R, Zadlo T, Gawron K, Wladyka B. Int J Mol Sci. 2022, 23, 6443. DOI: 10.3390/ijms23126443.
  9. Mechanism of MyD88S mediated signal termination. Pustelny K, Kuska K, Gorecki A, Musielak B, Dobosz E, Wladyka B, Koziel J, Czarna A, Holak T, Dubin G. Cell Commun Signal. 2022, 20, 10. DOI: 10.1186/s12964-021-00811-1.
  10. The Role of Candida albicans Virulence Factors in the Formation of Multispecies Biofilms With Bacterial Periodontal Pathogens. Satala D, Gonzalez-Gonzalez M, Smolarz M, Surowiec M, Kulig K, Wronowska E, Zawrotniak M, Kozik A, Rapala-Kozik M, Karkowska-Kuleta J. Front Cell Infect Microbiol. 2022, 11, 765942. DOI: 10.3389/fcimb.2021.765942.
  11. Similarities and Differences among Species Closely Related to Candida albicans: C. tropicalis, C. dubliniensis, and C. auris. Satala D, Juszczak M, Wronowska E, Surowiec M, Kulig K, Kozik A, Rapala-Kozik M, Karkowska-Kuleta J. Cellular Microbiology. 2022, 2022, 2599136. DOI: 10.1155/2022/2599136.

» 2021

  1. Isolation, Identification, and Bioinformatic Analysis of Antibacterial Proteins and Peptides from Immunized Hemolymph of Red Palm Weevil Rhynchophorus ferrugineus. Knutelski, S.; Awad, M.; Łukasz, N.; Bukowski, M.; Śmiałek, J.; Suder, P.; Dubin, G.; Mak, P. Biomolecules 2021, 11, 83. DOI: 10.3390/biom11010083.
  2. A comparison of the production of antimicrobial peptides and proteins by Galleria mellonella larvae in response to infection with two Pseudomonas aeruginosa strains differing in the profile of secreted proteases. Andrejko M, Mak P, Siemińska-Kuczer A, Iwański B, Wojda I, Suder P, Kuleta P, Regucka K, Cytryńska M. J Insect Physiol. 2021, 131, 104239. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2021.104239.
  3. Structure, Biosynthesis, and Biological Activity of Succinylated Forms of Bacteriocin BacSp222. Śmiałek J., Nowakowski M., Bzowska M., Bocheńska O., Wlizło A., Kozik A., Dubin G., Mak P. Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 6256. DOI: 10.3390/ijms22126256.
  4. Human skin microbiota-friendly lysostaphin. Bonar E., Bukowski M., Chlebicka K., Madry A., Bereznicka A., Kosecka-Strojek M., Dubin G., Miedzobrodzki J., Mak P., Wladyka B. Int. J. Biol. Macromol. 2021, 183, 852-860, DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2021.04.154.
  5. Fungal α-1,3-Glucan as a New Pathogen-Associated Molecular Pattern in the Insect Model Host Galleria mellonella. Stączek S, Zdybicka-Barabas A, Wojda I, Wiater A, Mak P, Suder P, Skrzypiec K, Cytryńska M. Molecules 2021, 26, 5097. DOI:10.3390/molecules26165097.
  6. Towards understanding the novel adhesin function of Candida albicans phosphoglycerate mutase at the pathogen cell surface: some structural analysis of the interactions with human host extracellular matrix proteins. Satala D, Zelazna A, Satala G, Bukowski M, Zawrotniak M, Rapala-Kozik M, Kozik A. Acta Biochim. Pol. 2021 14, 68, 515-525. DOI: 10.18388/abp.2020_5959.
  7. Effect of Staphylococcus aureus infection on the heat stress protein 70 (HSP70) level in chicken embryo tissues. Kosecka-Strojek M, Trzeciak J, Homa J, Trzeciak K, Władyka B, Trela M, Międzobrodzki J, Lis MW. Poult Sci. 2021,100, 101119. DOI: 10.1016/j.psj.2021.101119.
  8. Als3-mediated attachment of enolase on the surface of Candida albicans cells regulates their interactions with host proteins. Karkowska-Kuleta J, Wronowska E, Satala D, Zawrotniak M, Bras G, Kozik A, Nobbs AH, Rapala-Kozik. M. Cell Microbiol. 2021, 23, e13297. DOI: 10.1111/cmi.13297.
  9. Impacts of the Type I Toxin-Antitoxin System, SprG1/SprF1, on Staphylococcus aureus Gene Expression. Chlebicka K, Bonar E, Suder P, Ostyn E, Felden B, Wladyka B, Pinel-Marie ML.. Genes 2021, 12, 770. DOI: 10.3390/genes12050770.
  10. Macrocyclic Peptide Inhibitor of PD-1/PD-L1 Immune Checkpoint. Magiera-Mularz, K., Kuska, K., Skalniak, L., Grudnik, P., Musielak, B., Plewka, J., Kocik, J., Stec, M., Weglarczyk, K., Sala, D., Wladyka, B., Siedlar, M., Holak, T.A. and Dubin, G. Adv. Therap. 2021, 4, 2000195. DOI: 10.1002/adtp.202000195.
  11. Candida albicans and Candida glabrata triosephosphate isomerase - a moonlighting protein that can be exposed on the candidal cell surface and bind to human extracellular matrix proteins. Satala D, Satala G, Zawrotniak M, Kozik A. BMC Microbiol. 2021  21, 199. DOI: 10.1186/s12866-021-02235-w.
  12. Proteinous Components of Neutrophil Extracellular Traps Are Arrested by the Cell Wall Proteins of Candida albicans during Fungal Infection, and Can Be Used in the Host Invasion. Karkowska-Kuleta J, Smolarz M, Seweryn-Ozog K, Satala D, Zawrotniak M, Wronowska E, Bochenska O, Kozik A, Nobbs AH, Gogol M, Rapala-Kozik M.. Cells. 2021, 10, 2736. DOI: 10.3390/cells10102736.
  13. Als3-mediated attachment of enolase on the surface of Candida albicans cells regulates their interactions with host proteins. Karkowska-Kuleta J, Wronowska E, Satala D, Zawrotniak M, Bras G, Kozik A, Nobbs AH, Rapala-Kozik M. Cell Microbiol. 2021, 23, e13297. DOI: 10.1111/cmi.13297.
  14. Structural Determinants of Substrate Specificity of SplF Protease from Staphylococcus aureus Stach N, Karim A, Golik P, Kitel R, Pustelny K, Gruba N, Groborz K, Jankowska U, Kedracka-Krok S, Wladyka B, Drag M, Lesner A, Dubin G.. Int J Mol Sci. 2021, 22, , 2220. DOI: 10.3390/ijms22042220.
  15. Aldolaza fruktozobisfosforanowa - enzym do zadań specjalnych. Kamila Kulig. Zagadnienia aktualnie poruszane przez Młodych Naukowców (Creativetime, Kraków) 2021, 18, 75-78.
  16. Sterowanie losami miofibroblastów : nowe podejście w terapii chorób zwłóknieniowych. Ewelina Wronowska. Zagadnienia aktualnie poruszane przez Młodych Naukowców (Creativetime, Kraków) 2021, 19, 23-27.
  17. Fosfogliceromutaza - wielofunkcyjny enzym glikolityczny. Aleksnadra Żelazna. Zagadnienia aktualnie poruszane przez Młodych Naukowców (Creativetime, Kraków) 2021, 19, 18-22.

» 2020

  1. Candida albicans Shields the Periodontal Killer Porphyromonas gingivalis from Recognition by the Host Immune System and Supports the Bacterial Infection of Gingival Tissue. Dominika Bartnicka, Miriam Gonzalez-Gonzalez, Joanna Sykut, Joanna Koziel, Izabela Ciaston, Karina Adamowicz, Grazyna Bras, Marcin Zawrotniak, Justyna Karkowska-Kuleta, Dorota Satala, Andrzej Kozik, Edyta Zyla, Katarzyna Gawron, Katarzyna Lazarz-Bartyzel, Maria Chomyszyn-Gajewska, Maria Rapala-Kozik. International Journal of Molecular Sciences, 2020, vol. 21, article number: 1984, DOI: 10.3390/ijms21061984
  2. Kallikrein-Related Peptidase 14 Activates Zymogens of Membrane Type Matrix Metalloproteinases (MT-MMPs)-A CleavEx Based Analysis. Katherine Falkowski, Ewa Bielecka, Ida B Thøgersen, Oliwia Bocheńska, Karolina Płaza, Magdalena Kalińska, Laura Sąsiadek, Małgorzata Magoch, Aleksandra Pęcak, Magdalena Wiśniewska, Natalia Gruba, Magdalena Wysocka, Anna Wojtysiak, Magdalena Brzezińska-Bodal, Kamila Sychowska, Anastasija Pejkovska, Maren Rehders, Georgina Butler , Christopher M Overall, Klaudia Brix, Grzegorz Dubin, Adam Lesner, Andrzej Kozik, Jan J Enghild, Jan Potempa, Tomasz Kantyka. International Journal of Molecular Sciences, 2020, vol. 21, article number: 4383, DOI: 10.3390/ijms21124383.
  3. Chromosomal localization of PemIK toxin-antitoxin system results in the loss of toxicity - Characterization of pemIKSa1-Sp from Staphylococcus pseudintermedius. Monika Janczak, Karolina Hyz, Michał Bukowski, Robert Łyżeń, Marcin Hydzik, Grzegorz Węgrzyn, Agnieszka Szalewska-Pałasz, Przemysław Grudnik, Grzegorz Dubin, Benedykt Władyka. Microbiological Research, 2020, vol. 240, article number: 126529, DOI: 10.1016/j.micres.2020.126529
  4. Peptidylarginine Deiminase of Porphyromonas gingivalis Modulates the Interactions between Candida albicans Biofilm and Human Plasminogen and High-Molecular-Mass Kininogen. Justyna Karkowska-Kuleta, Magdalena Surowiec, Mariusz Gogol, Joanna Koziel, Barbara Potempa, Jan Potempa, Andrzej Kozik, Maria Rapala-Kozik. International Journal of Molecular Sciences, 2020, vol. 21, article number: 2495, DOI: 10.3390/ijms21072495.
  5. Characteristics of Extracellular Vesicles Released by the Pathogenic Yeast-Like Fungi Candida glabrata, Candida parapsilosis and Candida tropicalis. Justyna Karkowska-Kuleta, Kamila Kulig, Elzbieta Karnas, Ewa Zuba-Surma, Olga Woznicka, Elzbieta Pyza, Patryk Kuleta, Artur Osyczka, Maria Rapala-Kozik, Andrzej Kozik. Cells, 2020, vol. 9, article number: 1722, DOI: 10.3390/cells9071722.
  6. Docking interactions determine early cleavage events in insulin proteolysis by pepsin: Experiment and simulation. Michał Koliński, Sebastian Kmiecik, Robert Dec, Marcin Piejko, Paweł Mak, Wojciech Dzwolak. International Journal of Biological Macromolecules, 2020, vol. 149, 1151-1160, DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2020.01.253.
  7. Kallikrein 13 serves as a priming protease during infection by the human coronavirus HKU1. Aleksandra Milewska, Katherine Falkowski, Magdalena Kulczycka, Ewa Bielecka, Antonina Naskalska, Pawel Mak, Adam Lesner, Marek Ochman, Maciej Urlik, Elftherios Diamandis, Ioannis Prassas, Jan Potempa, Tomasz Kantyka, Krzysztof Pyrc. Science Signaling 2020, vol. 13, article number: eaba9902, DOI: 10.1126/scisignal.aba9902
  8. Choline Supplementation Sensitizes Legionella dumoffii to Galleria mellonella Apolipophorin III. Marta Palusińska-Szysz, Agnieszka Zdybicka-Barabas, Rafał Luchowski, Emilia Reszczyńska, Justyna Śmiałek, Paweł Mak, Wiesław I Gruszecki, Małgorzata Cytryńska. International Journal of Molecular Sciences, 2020, vol. 21, article number: 5818, DOI: 10.3390/ijms21165818.
  9. Identification and characterization of Staphylococcus spp. and their susceptibility to insect apolipophorin III. Marta Palusińska-Szysz, Agnieszka Zdybicka-Barabas, Magdalena Frąc, Wiesław I Gruszecki, Sylwia Wdowiak-Wróbel, Emilia Reszczyńska, Dorota Skorupska, Paweł Mak, Małgorzata Cytryńska. Future Microbiology, 2020, vol. 15, 1015-1032, DOI: 10.2217/fmb-2019-0328
  10. Anti-CD44 DNA Aptamers Selectively Target Cancer Cells. Aleksandra Pęcak, Łukasz Skalniak, Katarzyna Pels, Mirosław Książek, Mariusz Madej, Dobrosława Krzemień, Stanisław Malicki, Benedykt Władyka, Adam Dubin, Tadeusz Holak, Grzegorz Dubin. Nucleic Acid Therapeutics, 2020, vol. 30, 289-298, DOI: 10.1089/nat.2019.0833.
  11. Structural Insights into the Interactions of Candidal Enolase with Human Vitronectin, Fibronectin and Plasminogen. Dorota Satala, Grzegorz Satala, Justyna Karkowska-Kuleta, Michal Bukowski, Anna Kluza, Maria Rapala-Kozik, Andrzej Kozik. International Journal of Molecular Sciences, 2020, vol. 21, article number: 7843, DOI: 10.3390/ijms21217843.
  12. Antifungal Activity of Anionic Defense Peptides: Insight into the Action of Galleria mellonella Anionic Peptide 2. Aneta Sowa-Jasiłek, Agnieszka Zdybicka-Barabas, Sylwia Stączek, Bożena Pawlikowska-Pawlęga, Katarzyna Grygorczuk-Płaneta, Krzysztof Skrzypiec, Wiesław I Gruszecki, Paweł Mak, Małgorzata Cytryńska. International Journal of Molecular Sciences 2020, vol. 21, article number: 1912, DOI: 10.3390/ijms21061912.
  13. Plant-Derived Substances in the Fight Against Infections Caused by Candida Species. Ibeth Guevara-Lora, Grazyna Bras, Justyna Karkowska-Kuleta, Miriam González-González, Kinga Ceballos, Wiktoria Sidlo, Maria Rapala-Kozik. International Journal of Molecular Sciences, 2020, vol. 21, article number: 6131, DOI: 10.3390/ijms21176131.
  14. Moonlighting Proteins at the Candidal Cell Surface. Dorota Satala, Justyna Karkowska-Kuleta, Aleksandra Zelazna, Maria Rapala-Kozik, Andrzej Kozik. Microorganisms, 2020, vol. 8, article number: 1046, DOI: 10.3390/microorganisms8071046.
  15. Application of Two-Dimensional Difference Gel Electrophoresis in Identification of Factors Responsible for Virulence of Staphylococcus aureus. Emilia Bonar, Kinga Chlebicka, Grzegorz Dubin, Benedykt Władyka. In: Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus (MRSA) Protocols: Cutting-Edge Technologies and Advancements. Methods in Molecular Biology, Editor: Yinduo J. Rozdział 11, strony 139-154, DOI: 10.1007/978-1-4939-9849-4_11, ISBN 978-1-4939-9848-7, ISBN 978-1-4939-9849-4 (eBook), Humana Press (Springer Nature).
  16. Techniki omiczne. Kinga Chlebicka. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 17. Editor: Piech K., Rozdział: Nauki Przyrodnicze, strony 65-68, ISBN: 978-83-63058-97-5, Creativetime.
  17. Właściwości przeciwzapalne i antyoksydacyjne ekstraktów z roślin rodzaju Brassica oraz ich możliwości aplikacyjne w medycynie. Katarzyna Kamuda, Piotr Szafran, Ibeth Guevara-Lora. In: Zastosowanie roślin w naukach medycznych i przyrodniczych”, Editor: Mariola Janiszewska. Rozdział 7, strony 91-104, ISBN 978-83-66489-35-6, Wydawnictwo Naukowe TYGIEL sp. z o.o., Lublin.
  18. Pęcherzyki zewnątrzkomórkowe – ich rola w stanach chorobowych. Kamila Kulig. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 17. Editor: Piech K., Rozdział: Nauki Przyrodnicze, strony 60-64, ISBN: 978-83-63058-97-5, Creativetime.
  19. Mechanizmy działania toksyn z bakteryjnych systemów toksyna-antytoksyna. Anna Mądry, Benedykt Władyka. In: Najnowsze doniesienia zakresu mikrobiologii i biologii molekularnej, Editor: Danielewska A. i Mołdoch-Mendoń I., Rozdział 8, strony 107-125, ISBN 978-83-66489-15-8, Wydawnictwo Naukowe TYGIEL sp. z o.o., Lublin.
  20. Makrofagi – komórki o wielu twarzach. Ewelina Wronowska. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 17. Editor: Piech K., Rozdział: Nauki Przyrodnicze, strony 32-37, ISBN: 978-83-63058-97-5, Creativetime.
  21. Moonlighting proteins w komórkach bakteryjnych i drożdżowych – jak białka dorabiają po godzinach. Ewelina Wronowska. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 16. Editor: Piech K., strony 36-41, ISBN: 978-83-63058-94-4, Creativetime.
  22. Mechanizm działania substancji psychoaktywnych – molekularna geneza uzależnień. Aleksandra Żelazna. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 16. Editor: Piech K., strony 47-52, ISBN: 978-83-63058-94-4, Creativetime.
  23. Rola dopaminy w pląsawicy Huntingtona. Aleksandra Żelazna. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 17. Editor: Piech K. Rozdział: Nauki Przyrodnicze, strony 24-28, ISBN: 978-83-63058-97-5, Creativetime.

» 2019

  1. Moonlighting proteins are variably exposed at the cell surfaces of Candida glabrata, Candida parapsilosis and Candida tropicalis under certain growth conditions. Karkowska-Kuleta Justyna, Satala  Dorota, Bochenska Oliwia, Rapala-Kozik Maria, Kozik Andrzej (2019) BMC Microbiology 2019;19:149, DOI: 10.1186/s12866-019-1524-5.
  2. Adhesive protein-mediated cross-talk between Candida albicans and Porphyromonas gingivalis in dual species biofilm protects the anaerobic bacterium in unfavorable oxic environment. Bartnicka Dominika, Karkowska-Kuleta Justyna, Zawrotniak Marcin, Satala Dorota, Michalik Kinga, Zielinska Gabriela, Bochenska Oliwia, Kozik Andrzej, Ciaston Izabela, Koziel Joanna, Dutton Lindsay C, Nobb Angela H, Potempa Barbara, Baster Zbigniew, Rajfur Zenon, Potempa Jan, Rapala-Kozik Maria, Scientific Reports 2019;9:4376, DOI: 10.1038/s41598-019-40771-8.
  3. The antimicrobial activity of chemerin-derived peptide p4 requires oxidative conditions. Godlewska Urszula, Bilska Bernadetta, Zegar Aneta, Brzoza Piotr, Borek Arkadiusz, Murzyn Krzysztof, Bochenska Oliwia, Morytko Agnieszka, Kuleta Patryk, Kozik Andrzej, Pyza Elżbieta, Osyczka Artur, Zabel Brian A, Cichy Joanna. Journal of Biological Chemistry 2019, vol. 294, pages: 1267-1278. DOI: 10.1074/jbc.RA118.005495.
  4. The analysis of human leukocyte antigen-G level in patients with endometrial cancer by Western blot technique. Walentowicz-Sadlecka Malgorzata, Dziobek  Konrad, Grabiec Marek, Sadlecki Pawel, Walentowicz Pawel, Mak Pawel, Szymankiewicz Maria, Kwinta Przemko, Dutsch-Wicherek Magdalena. American Journal of Reproductive Immunology, 2019, vol. 81, article number: e13070. DOI: 10.1111/aji.13070.  
  5. Identification of Antioxidant Peptides in Enzymatic Hydrolysates of Carp (Cyprinus Carpio) Skin Gelatin. Tkaczewska Joanna, Bukowski Michal, Mak Pawel. Molecules, 2019, vol. 24, article number: 97. DOI: 10.3390/molecules24010097.
  6. Studies on the interactions of neutral Galleria mellonella cecropin D with living bacterial cells. Zdybicka-Barabas Agnieszka, Staczek Sylwia, Pawlikowska-Pawlega Bozena, Mak Pawel, Luchowski Rafal, Skrzypiec Krzysztof, Mendyk Ewaryst, Wydrych Jerzy, Gruszecki Wieslaw, Cytrynska Malgorzata. Amino Acids, 2019, vol. 51, pages: 175-191. DOI: 10.1007/s00726-018-2641-4.
  7. Host-pathogen interactions upon the first and subsequent infection of Galleria mellonella with Candida albicans. Vertyporokh Lidiia, Kordaczuk Jakub, Mak Pawel, Hulas-Stasiak Monika, Wojda Iwona. Journal of Insect Physiology, 2019, vol. 117, article number: 103903. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2019.103903.
  8. Prevalence of Antibiotic and Heavy Metal Resistance Determinants and Virulence-Related Genetic Elements in Plasmids of Staphylococcus aureus. Bukowski Michał, Piwowarczyk Rafał, Mądry Anna, Zagórski-Przybyło Rafał, Hydzik Marcin, Władyka Benedykt. Frontiers in Microbiology, 2019, vol. 10, article number: 805. DOI: 10.3389/fmicb.2019.00805.
  9. Crystal structure of Maternal Embryonic Leucine Zipper Kinase (MELK) in complex with dorsomorphin (Compound C). Rembacz Krzysztof P., Źrubek Karol M., Golik Przemysław, Michalik Kinga, Bogusz Józefina, Władyka Benedykt, Romanowska Małgorzata, Dubin Grzegorz. Archives of Biochemistry and Biophysics, 2019, vol. 671, pages: 1-7. DOI: 10.1016/
  10. Production of Lysostaphin by Nonproprietary Method Utilizing a Promoter from Toxin-Antitoxin System. Mądry Anna, Jendroszek Agnieszka, Dubin Grzegorz, Władyka Benedykt. Molecular Biotechnology, 2019, vol. 61, pages: 774-782. DOI: 10.1007/s12033-019-00203-4.
  11. Cold-modulated small proteins abundance in winter triticale (x Triticosecale, Wittm.) seedlings tolerant to the pink snow mould (Microdochium nivale, Samuels & Hallett) infection. Gołębiowska Gabriela, Bonar Emilia, Emami Kaveh, Wędzony Maria. Acta Biochimica Polonica, 2019, vol. 66, pages: 343-350. DOI: 10.18388/abp.2019_2804.
  12. Proteomic characterization of early lung response to breast cancer metastasis in mice. Kurpinska Anna, Suraj Joanna, Bonar Emilia, Zakrzewska Agnieszka, Stojak Marta, Sternak Magdalena, Jasztal Agnieszka, Walczak Maria. Experimental and Molecular Pathology, 2019; vol. 107, pages: 129–140. DOI: 10.1016/j.yexmp.2019.02.001.
  13. Rapala-Kozik Maria, Zawrotniak Marcin, Gogol Mariusz, Bartnicka Dominika, Satała Dorota, Smolarz Magdalena, Karkowska-Kuleta Justyna, Kozik Andrzej (2019) Interaction of Candida albicans cells with aerobic and anaerobic bacteria during formation of mixed biofilm in oral cavity. In: Candida albicans, Editor: Sandai D., rozdział 1, strony: 119-142, DOI:10.5772/intechopen.81537, ISBN 978-953-51-6399, InTech Open.
  14. Satała Dorota (2019) Alternatywne modele zwierzęce stosowane do badania infekcji grzybiczych. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców T. 15, Editor: Piech Krzysztof, rozdział: Biologia/Biochemia /Medycyna/Żywienie, strony: 107-113, ISBN: 978-83-63058-89-0, wydawca: Creativetime, Kraków.
  15. Żelazna Aleksandra (2019) Substancje pochodzenia naturalnego w walce z chorobami grzybiczymi. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców T. 15, Editor: Piech Krzysztof, rozdział: Biologia/Biochemia /Medycyna/Żywienie, strony: 85-89, ISBN: 978-83-63058-89-0, wydawca: Creativetime, Kraków.

» 2018

  1. Stączek S, Zdybicka-Barabas A, Mak Paweł, Sowa-Jasiłek A, Kedracka-Krok Sylwia, Jankowska U, Suder P, Wydrych J, Grygorczuk K, Jakubowicz T, Cytryńska M. Studies on localization and protein ligands of Galleria mellonella apolipophorin III during immune response against different pathogens. J Insect Physiol. 2018 Feb - Mar;105:18-27. doi: 10.1016/j.jinsphys.2017.12.009.
  2. Klaus Tomasz, Stalińska Krystyna, Czaplicki Dominik, Mak Paweł, Skupien-Rabian Bozena, Kedracka-Krok Sylwia, Wiatrowska Karolina, Bzowska Monika, Machula Monika, Bereta Joanna. Mouse Antibody of IgM Class is Prone to Non-Enzymatic Cleavage between CH1 and CH2 Domains. Sci Rep. 2018 Jan 11;8(1):519. doi: 10.1038/s41598-017-19003-4.
  3. Nowakowski M, Jaremko Ł, Wladyka Benedykt, Dubin Grzegorz, Ejchart A, Mak Paweł. Spatial attributes of the four-helix bundle group of bacteriocins - The high-resolution structure of BacSp222 in solution. Int J Biol Macromol. 2018 Feb;107(Pt B):2715-2724. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2017.10.158.
  4. Bonar Emilia, Bukowski Michał, Hydzik Marcin, Jankowska U, Kędracka-Krok Sylwia, Groborz Magdalena, Dubin Grzegorz, Akkerboom V, Międzobrodzki Jacek, Sabat AJ, Friedrich AW, Władyka Benedykt. Joint Genomic and Proteomic Analysis Identifies Meta-Trait Characteristics of Virulent and Non-virulent Staphylococcus aureus Strains. Front Cell Infect Microbiol. 2018 Sep 6;8:313. doi: 10.3389/fcimb.2018.00313.
  5. Stach Natalia, Kalinska Magdalena, Zdzalik Michał, Kitel R, Karim Abdulkarim, Serwin Karol, Rut W, Larsen K, Jabaiah A, Firlej Magdalena, Władyka Benedykt, Daugherty P, Stennicke H, Drag M, Potempa Jan, Dubin Grzegorz. Unique Substrate Specificity of SplE Serine Protease from Staphylococcus aureus. Structure. 2018 Apr 3;26(4):572-579.e4. doi: 10.1016/j.str.2018.02.008.
  6. Dygut J, Piwowar M, Fijałkowska K, Guevara Ibeth, Jakubas R, Gonzales G, Popławski K, Strokowska A, Wikariak H, Jurkowski W. Effect of Cabbage Wraps on the Reduction of Post-Traumatic Knee Exudates in Men. J Altern Complement Med. 2018 May;24(11):1113-19. doi: 10.1089/acm.2017.0304.
  7. Niewiarowska Anna, Łabędź-Masłowska Anna, Kozik Andrzej, Guevara-Lora Ibeth. Bradykinin B2 and dopamine D2 receptors cooperatively contribute to the regulation of neutrophil adhesion to endothelial cells. Acta Biochim Pol. 2018 65(3):367-75.
  8. Niewiarowska-Sendo Anna, Kozik Andrzej, Guevara-Lora Ibeth. Influence of bradykinin B2 receptor and dopamine D2 receptor on oxidative stress, inflammatory response, and apoptotic processes in human endothelial cells.PLoS ONE 2018; 13(11): e0206443.
  9. Siudut J, Natorska J, Zabczyk M, Zajac Dorota, Seweryn Karolina, Rapala-Kozik M, Undas A. Impaired plasminogen binding in patients with venous thromboembolism: Association with protein carbonylation. Thromb Res. 2018; 163:12-18.
  10. Karkowska-Kuleta Justyna, Bartnicka Dominika, Zawrotniak Marcin, Zielinska Gabriela, Kieronska Anna, Bochenska Oliwia, Ciaston Izabela, Koziel Joanna, Potempa Jan, Baster Z, Rajfur Z, Rapala-Kozik Maria. The activity of bacterial peptidylarginine deiminase is important during formation of dual-species biofilm by periodontal pathogen Porphyromonas gingivalis and opportunistic fungus Candida albicans. Pathogens and Disease 2018; 76(4):Article No: fty033.
  11. Rapala-Kozik Maria, Bochenska Oliwia, Zajac Dorota, Karkowska-Kuleta Justyna, Gogol Mariusz, Zawrotniak Marcin, Kozik Andrzej (2018) Extracellular proteinases of Candida species pathogenic yeasts. Mol Oral Microbiol. 33(2):113-124.
  12. Mak Paweł (2018) Staphylococcal Bacteriocins. In: Pet-to-Man Travelling Staphylococci: A World in Progress, Editor: Savini V., rozdział 13, strony: 161-171, doi: 10.1016/B978-0-12-813547-1.00013-3, ISBN: 9780128135488, ISBN: 9780128135471, Elsevier
  13. Władyka Benedykt, Bonar Emilia (2018) Application of Staphylococci in the Food Industry and Biotechnology. In: Pet-to-Man Travelling Staphylococci: A World in Progress, Editor: Savini V. Rozdział 21, strony: 281-291, DOI: 10.1016/B978-0-12-813547-1.00021-2, ISBN: 9780128135488, ISBN: 9780128135471, Elsevier
  14. Bonar Emilia, Międzobrodzki Jacek, Władyka Benedykt (2018) The Staphylococcal Coagulases. In: Pet-to-Man Travelling Staphylococci: A World in Progress, Editor: Savini V. Rozdział 7, strony: 95-102, DOI: 10.1016/B978-0-12-813547-1.00007-8, ISBN: 9780128135488, ISBN: 9780128135471, Elsevier
  15. Stach Natalia, Kaszycki P., Władyka Benedykt, Dubin Grzegorz (2018) Extracellular Proteases of Staphylococcus spp. In: Pet-to-Man Travelling Staphylococci: A World in Progress, Editor: Savini V. Rrozdział 11, strony: 135-145, DOI: 10.1016/B978-0-12-813547-1.00011-X, ISBN: 9780128135488, ISBN: 9780128135471, Elsevier
  16. Bukowski Michał, Władyka Benedykt, Dubin Adam, Dubin Grzegorz (2018) The Staphylococcal Exfoliative Toxins In: Pet-to-Man Travelling Staphylococci: A World in Progress, Editor: Savini V. Rozdział 10, strony: 127-133, DOI: 10.1016/B978-0-12-813547-1.00010-8, ISBN: 9780128135488, ISBN: 9780128135471, Elsevier
  17. Rapala-Kozik Maria, Zawrotniak Marcin, Gogol Mariusz, Bartnicka Dominika, Satała Dorota, Smolarz Magdalena, Karkowska-Kuleta Justyna, Kozik Andrzej (2018) Interaction of Candida albicans cells with aerobic and anaerobic bacteria during formation of mixed biofilm in oral cavity. In: Candida albicans, Editor: Sandai D. Rozdział 1, strony: 2-25, DOI:10.5772/intechopen.81537, ISBN 978-953-51-6399, InTech Open
  18. Satała Dorota, Żelazna Aleksandra (2018) Candida glabrata – niebezpieczny krewny drożdży piekarskich  Saccharomyces cerevisiae. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 12. Editor: Krzysztof Piech, rozdział Biochemia/Biologia/Medycyna/Żywienie, strony: 162-167, ISBN: 978-83-63058-81-4, CREATIVETIME, Kraków

» 2017

  1. Niewiarowska-Sendo Anna, Polit Agnieszka, Piwowar M, Tworzydło Magdalena, Kozik Andrzej, Guevara Lora Ibeth. Bradykinin B2 and dopamine D2 receptors form a functional dimer. Biochim Biophys Acta. Molecular Cell Research. 2017 Oct;1864(10):1855-1866. doi: 10.1016/j.bbamcr.2017.07.012.
  2. Zawrotniak Marcin, Bocheńska Oliwia, Karkowska-Kuleta Justyna, Seweryn-Ożóg Karolina, Aoki W, Ueda M, Kozik Andrzej, Rąpała-Kozik Maria. Aspartic proteases and major cell wall components in Candida albicans trigger the release of neutrophil extracellular traps. Front Cell Infect Microbiol. 2017 Sep 21;7:414. doi: 10.3389/fcimb.2017.00414.
  3. Bukowski Michał, Hyz Karolina, Janczak Monika, Hydzik Marcin, Dubin Grzegorz, Władyka Benedykt. Identification of novel mazEF/pemIK family toxin-antitoxin loci and their distribution in the Staphylococcus genus. Sci Rep. 2017 Oct 18;7(1):13462. doi: 10.1038/s41598-017-13857-4.
  4. Bogusz Józefina, Źrubek Karol, Rembacz Krzysztof, Grudnik Przemysław, Golik Przemysław, Romanowska Małgorzata, Władyka Benedykt, Dubin Grzegorz. Structural analysis of PIM1 kinase complexes with ATP-competitive inhibitors. Sci Rep. 2017 Oct 17;7(1):13399. doi: 10.1038/s41598-017-13557-z.
  5. Szelążek Bożena, Kabała Wojciech, Kus K, Zdżalik Michał, Twarda-Cłapa A, Golik Przemysław, Burmistrz Michał, Florek Dominik, Władyka Benedykt, Pyrć Krzysztof, Dubin Grzegorz. Structural Characterization of Human Coronavirus NL63 N Protein. J Virol. 2017 May 12;91(11). pii: e02503-16. doi: 10.1128/JVI.02503-16.
  6. Skrzeczynska-Moncznik Joanna, Zabieglo Katarzyna, Bossowski Józef, Osiecka Oktawia, Wlodarczyk Agnieszka, Kapinska-Mrowiecka M, Kwitniewski Mateusz, Majewski Paweł, Dubin Adam, Cichy Joanna. Eosinophils Regulate Interferon Alpha Production in Plasmacytoid Dendritic Cells Stimulated with Components of Neutrophil Extracellular Traps. J Interferon Cytokine Res. 2017 Mar;37(3):119-128. doi: 10.1089/jir.2016.0036
  7. Ostrowska K, Stadnicka K, Gryl M , Musielak B, Witek Ł, Bocheńska Oliwia. Synthesis, structure, and photophysical properties of luminescent zinc and cadmium complexes containing 2-pyridyl-substituted pyrrolo[2,3-b]quinoxaline. Polyhedron. 2017 vol. 133, p. 294-301. doi:10.1016/j.poly.2017.05.037.
  8. Karkowska-Kuleta Justyna, Zając Dorota, Braś Grażyna, Bocheńska Oliwia, Rąpała-Kozik Maria, Kozik Andrzej. Binding of human plasminogen and high-molecular-mass kininogen by cell surface-exposed proteins of Candida parapsilosis. Acta Biochim Pol. 2017;64(3):391-400. doi: 10.18388/abp.2017_1609.
  9. Muszyńska Klaudia, Ostrowska Dominika, Bartnicki Filip, Kowalska Ewa, Bodaszewska-Lubaś Małgorzata, Hermanowicz Paweł, Faulstich H, Strzałka Wojciech. Selection and analysis of a DNA aptamer binding α-amanitin from Amanita phalloides. Acta Biochim Pol. 2017;64(3):401-406. doi: 10.18388/abp.2017_1615.
  10. Wolak Natalia, Zawrotniak Marcin, Gogól Mariusz, Kozik Andrzej, Rąpała-Kozik Maria. Vitamins B1, B2, B3 and B9 : occurrence, biosynthesis pathways and functions in human nutrition. Mini Rev Med Chem. 2017;17(12):1075-1111. doi: 10.2174/1389557516666160725095729.
  11. Karkowska-Kuleta Justyna. Charakterystyka fenotypowego przełączania gatunku Candida albicans. Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców 11. 2017; str. 29-33; red. Marcin Kuczera, CREATIVETIME, Kraków. ISBN 978-83-63058-72-2
  12. Biela Maria, Kocik Justyna, Niewiarowska-Sendo Anna. Wpływ peptydów kininowych na regulację procesów oksydacyjno-redukcyjnych w chorobach nowotworowych. Zagadnienia Aktualnie Poruszanie Przez Młodych Naukowców 10. 2017; str. 98-103; red. Marcin Kuczera, CREATIVETIME, Kraków. ISBN: 978-83-63058-71-5.
  13. Zając Dorota. Rola reszt cukrowych obecnych na powierzchni grzybów chorobotwórczych Candida albicans. Spojrzenie młodych naukowców na rozwój nauk biologicznych i chemicznych. 2016; str. 26-31; red. Marcin Kuczera, CREATIVETIME, Kraków. ISBN 978-83-63058-66-1
  14. Gogól Mariusz, Bocheńska Oliwia, Zawrotniak Marcin, Karkowska-Kuleta Justyna, Zając Dorota,  Rąpała-Kozik Maria (2017) Roles of Candida albicans Aspartic Proteases in Host-Pathogen Interactions. In: Pathophysiological Aspects of Proteases, Editor: Chakraborti S, Dhalla NS, DOI: 10.1007/978-981-10-6141-7, ISBN 978-981-10-6140-0, ISBN 978-981-10-6141-7 (eBook),
  15. Zawrotniak Marcin, Kozik Andrzej, Rąpała-Kozik Maria (2017) Neutrophil Extracellular Traps in Infectious Human Diseases. In:  Role of Neutrophils in Disease Pathogenesis, Editor: Khajah M. DOI: 10.5772/intechopen.68443, ISBN 978-953-51-3196-0, Print ISBN 978-953-51-3195-3.
  16. Satała Dorota (2017) Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń bakteryjnych i grzybiczych. In: Zastosowanie wybranych nowoczesnych metod w biologii i medycynie, Editor: Karkowska-Kuleta Justyna, Miszczyk J. Karkowska-Kuleta Justyna, ISBN 978-83-63058-79-1,CREATIVETIME, Kraków.
  17. Znaczenie i badanie zjawiska quorum sensing w rozwoju infekcji grzybiczej. In: Zastosowanie wybranych nowoczesnych metod w biologii i medycynie. Editor: Karkowska-Kuleta Justyna, Miszczyk J. ISBN 978-83-63058-79-1, CREATIVETIME, Kraków.
  18. Niewiarowska-Sendo Anna (2017) Metody badania oddziaływań między receptorami błonowymi sprzężonymi z białkiem G. In: Zastosowanie wybranych nowoczesnych metod w biologii i medycynie. Editor: Karkowska-Kuleta Justyna, Miszczyk J. ISBN 978-83-63058-79-1, CREATIVETIME, Kraków.
  19. Karkowska-Kuleta Justyna (2017) Zastosowanie wybranych nowoczesnych metod w biologii i medycynie – Zakończenie. In:  Zastosowanie wybranych nowoczesnych metod w biologii i medycynie. Editor: Karkowska-Kuleta Justyna, Miszczyk J. ISBN 978-83-63058-79-1, CREATIVETIME, Kraków
  20. Karkowska-Kuleta Justyna (2017) Zastosowanie wybranych nowoczesnych metod w biologii i medycynie. Editor: Karkowska-Kuleta Justyna, Miszczyk J. Nakład 70 egzemplarzy (książka drukowana), ISBN 978-83-63058-79-1, CREATIVETIME, Kraków.

» 2016

  1. Niewiarowska-Sendo A, Kozik A, Guevara-Lora I. Kinin Peptides Enhance Inflammatory and Oxidative Responses Promoting Apoptosis in a Parkinson's Disease Cellular Model. Mediators Inflamm. 2016;2016:4567343.
  2. Guevara-Lora I, Niewiarowska-Sendo A, Polit A, Kozik A. Hypothetical orchestrated cooperation between dopaminergic and kinin receptors for the regulation of common functions. Acta Biochim Pol. 2016;63(3):387-96. doi: 10.18388/abp.2016_1366.
  3. Karkowska-Kuleta J, Zajac D, Bras G, Bochenska O, Seweryn K, Kedracka-Krok S, Jankowska U, Rapala-Kozik M, Kozik A. Characterization of the interactions between human high-molecular-mass kininogen and cell wall proteins of pathogenic yeasts Candida tropicalis. Acta Biochim Pol. 2016;63(3):427-36. doi: 10.18388/abp.2016_1353.
  4. Zajac D, Karkowska-Kuleta J, Bochenska O, Rapala-Kozik M, Kozik A. Interaction of human fibronectin with Candida glabrata epithelial adhesin 6 (Epa6). Acta Biochim Pol. 2016;63(3):417-26. doi: 10.18388/abp.2016_1328.
  5. Bochenska O, Rapala-Kozik M, Wolak N, Aoki W, Ueda M, Kozik A. The action of ten secreted aspartic proteases of pathogenic yeast Candida albicans on major human salivary antimicrobial peptide, histatin 5. Acta Biochim Pol. 2016;63(3):403-10. doi: 10.18388/abp.2016_1318. Epub 2016 Jul 8.
  6. Plaza K, Kalinska M, Bochenska O, Meyer-Hoffert U, Wu Z, Fischer J, Falkowski K, Sasiadek L, Bielecka E, Potempa B, Kozik A, Potempa J, Kantyka T. Gingipains of Porphyromonas gingivalis Affect the Stability and Function of Serine Protease Inhibitor of Kazal-type 6 (SPINK6), a Tissue Inhibitor of Human Kallikreins. J Biol Chem. 2016 Sep 2;291(36):18753-64. doi: 10.1074/jbc.M116.722942.
  7. Gogol M, Ostrowska D, Klaga K, Bochenska O, Wolak N, Aoki W, Ueda M, Kozik A, Rapala-Kozik M. Inactivation of α1-proteinase inhibitor by Candida albicans aspartic proteases favors the epithelial and endothelial cell colonization in the presence of neutrophil extracellular traps. Acta Biochim Pol. 2016;63(1):167-175. doi: 10.18388/abp.2015_1163. Epub 2015 Dec 7.
  8. Pieta P, Majewska M, Su Z, Grossutti M, Wladyka B, Piejko M, Lipkowski J, Mak P. (2016) Physicochemical Studies on Orientation and Conformation of a New Bacteriocin BacSp222 in a Planar Phospholipid Bilayer. Langmuir 32, 5653-62, doi: 10.1021/acs.langmuir.5b04741.
  9. Palusińska-Szysz M, Zdybicka-Barabas A, Reszczyńska E, Luchowski R, Kania M, Gisch N, Waldow F, Mak P, Danikiewicz W, Gruszecki WI, Cytryńska M. (2016) The lipid composition of Legionella dumoffii membrane modulates the interaction with Galleria mellonella apolipophorin III. Biochim. Biophys. Acta. 1861, 617-29, doi: 10.1016/j.bbalip.2016.04.011
  10. Sowa-Jasiłek A, Zdybicka-Barabas A, Staczek S, Wydrych J, Skrzypiec K, Mak P, Deryło K, Tchórzewski M, Cytrynska M. (2016) Galleria mellonella lysozyme induces apoptotic changes in Candida albicans cells. Mic. Res. 193, 121–131,
  11. Kosecka-Strojek M, Ilczyszyn WM, Buda A, Polakowska K, Murzyn K, Panz T, Bialecka A, Kasprowicz A, Jakubczak A, Krol J, Wieliczko A, Wladyka B, Miedzobrodzki J. Multiple-locus variable-number tandem repeat fingerprinting as a method for rapid and cost-effective typing of animal-associated Staphylococcus aureus strains from lineages other than sequence type 398. J Med Microbiol. 2016 Dec;65(12):1494-1504. doi: 10.1099/jmm.0.000378.
  12. Bonar E, Wojcik I, Jankowska U, Kedracka-Krok S, Bukowski M, Polakowska K, Lis MW, Kosecka-Strojek M, Sabat AJ, Dubin G, Friedrich AW, Miedzobrodzki J, Dubin A, Wladyka B. Identification of Secreted Exoproteome Fingerprints of Highly-Virulent and Non-Virulent Staphylococcus aureus Strains. Front Cell Infect Microbiol. 2016 May 6;6:51. doi: 10.3389/fcimb.2016.00051. eCollection 2016.
  13. Dziga D, Zielinska G, Wladyka B, Bochenska O, Maksylewicz A, Strzalka W, Meriluoto J. Characterization of Enzymatic Activity of MlrB and MlrC Proteins Involved in Bacterial Degradation of Cyanotoxins Microcystins.Toxins (Basel). 2016 Mar 16;8(3). pii: E76. doi: 10.3390/toxins8030076.

» 2015

  1. Kozik Andrzej, Gogol Mariusz, Bochenska Oliwia, Karkowska-Kuleta Justyna, Wolak Natalia, Kamysz W, Aoki W, Ueda M, Faussner A, Rapala-Kozik Maria. Kinin release from human kininogen by 10 aspartic proteases produced by pathogenic yeast Candida albicans. BMC Microbiol. 2015 Mar;15:60. doi: 10.1186/s12866-015-0394-8.
  2. Rapala-Kozik Maria, Bochenska Oliwia, Zawrotniak Marcin, Wolak Natalia, Trebacz Grzegorz, Gogol Mariusz, Ostrowska Dominika, Aoki W, Ueda M, Kozik Andrzej. Inactivation of the antifungal and immunomodulatory properties of human cathelicidin LL-37 by aspartic proteases produced by the pathogenic yeast Candida albicans. Infect Immun. 2015 Jun;83(6):2518-30. doi: 10.1128/IAI.00023-15.
  3. Bochenska Oliwia, Rapala-Kozik Maria, Wolak Natalia, Kamysz W, Grzywacz D, Aoki W, Ueda M, Kozik Andrzej. Inactivation of human kininogen-derived antimicrobial peptides by secreted aspartic proteases produced by the pathogenic yeast Candida albicans. Biol Chem. 2015 Dec;396(12):1369-75. doi: 10.1515/hsz-2015-0167.
  4. Janczak Monika, Bukowski Michał, Górecki Andrzej, Dubin Grzegorz, Dubin Adam, Władyka Benedykt. A systematic investigation of the stability of green fluorescent protein fusion proteins. Acta Biochim Pol. 2015;62(3):407-11. doi: 10.18388/abp.2015_1026.
  5. Kozik Andrzej, Karkowska-Kuleta Justyna, Zajac Dorota, Bochenska Oliwia, Kedracka-Krok Sylwia, Jankowska U, Rapala-Kozik Maria. Fibronectin-, vitronectin- and laminin-binding proteins at the cell walls of Candida parapsilosis and Candida tropicalis pathogenic yeasts. BMC Microbiol. 2015 Oct;15(1):197. doi: 10.1186/s12866-015-0531-4.
  6. Karkowska-Kuleta Justyna, Zajac Dorota, Bochenska Oliwia, Kozik Andrzej. Surfaceome of pathogenic yeasts, Candida parapsilosis and Candida tropicalis, revealed with the use of cell surface shaving method and shotgun proteomic approach. Acta Biochim Pol. 2015;62(4):807-19. doi: 10.18388/abp.2015_1140.
  7. Seweryn Karolina, Karkowska-Kuleta Justyna, Wolak Natalia, Bochenska Oliwia, Kedracka-Krok Sylwia, Kozik Andrzej, Rapala-Kozik Maria. Kinetic and thermodynamic characterization of the interactions between the components of human plasma kinin-forming system and isolated and purified cell wall proteins of Candida albicans. Acta Biochim Pol. 2015;62(4):825-35. doi: 10.18388/abp.2015_1142.
  8. Niewiarowska-Sendo Anna, Patrzalek Katarzyna, Kozik Andrzej, Guevara-Lora Ibeth. The effect of differentiation agents on inflammatory and oxidative responses of the human neuroblastoma cell line SK-N-SH. Acta Biochim Pol. 2015;62(3):435-43. doi: 10.18388/abp.2015_1039.
  9. Wladyka Benedykt, Piejko Marcin, Bzowska Monika, Pieta P, Krzysik Monika, Mazurek Łukasz, Guevara-Lora Ibeth, Bukowski Michał, Sabat AJ, Friedrich AW, Bonar Emilia, Międzobrodzki Jacek, Dubin Adam, Mak Paweł. A peptide factor secreted by Staphylococcus pseudintermedius exhibits properties of both bacteriocins and virulence factors. Sci Rep. 2015 Sep 28;5:14569. doi: 10.1038/srep14569.
  10. Wolak Natalia, Tomasi Massimo, Kozik Andrzej, Rapala-Kozik Maria. Characterization of thiamine uptake and utilization in Candida spp. subjected to oxidative stress. Acta Biochim Pol. 2015;62(3):445-55. doi: 10.18388/abp.2015_1044.
  11. Zawrotniak Marcin, Kozik Andrzej, Rapala-Kozik Maria. Selected mucolytic, anti-inflammatory and cardiovascular drugs change the ability of neutrophils to form extracellular traps (NETs). Acta Biochim Pol. 2015;62(3):465-73. doi: 10.18388/abp.2015_1055.
  12. Kujda M, Oćwieja M, Adamczyk Z, Bocheńska Oliwia, Braś Grażyna, Kozik Andrzej, Bielańska E, Barbasz J. Charge Stabilized Silver Nanoparticles Applied as Antibacterial Agents. J Nanosci Nanotechnol. 2015 May;15(5):3574-83. doi:
  13. Piejko Marcin, Dec R, Babenko V, Hoang A, Szewczyk M, Mak Pawel, Dzwolak W. Highly amyloidogenic two-chain peptide fragments are released upon partial digestion of insulin with pepsin. J Biol Chem. 2015 Mar;290(10):5947-58. doi: 10.1074/jbc.M114.608844.
  14. Szewczak J, Bierczyńska-Krzysik A, Piejko Marcin, Mak Paweł, Stadnik D. Isolation and characterization of acetylated derivative of recombinant insulin lispro produced in Escherichia coli. Pharm Res. 2015 Jul;32(7):2450-7. doi: 10.1007/s11095-015-1637-y.
  15. Pietrzyk AJ, Bujacz A, Mak Paweł, Potempa B, Niedziela T. Structural studies of Helix aspersa agglutinin complexed with GalNAc: A lectin that serves as a diagnostic tool. Int J Biol Macromol. 2015 Nov;81:1059-68. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2015.09.044.
  16. Karna N, Łęgowska A, Malicki Stanisław, Dębowski D, Golik Przemysław, Gitlin A, Grudnik Przemysław, Władyka Benedykt, Brzozowski K, Dubin Grzegorz, Rolka K. Investigation of Serine-Proteinase-Catalyzed Peptide Splicing in Analogues of Sunflower Trypsin Inhibitor 1 (SFTI-1). Chembiochem. 2015 Sep 21;16(14):2036-45. doi: 10.1002/cbic.201500296.
  17. Karkowska-Kuleta Justyna, Kozik Andrzej. Cell wall proteome of pathogenic fungi. Acta Biochim Pol. 2015;62(3):339-51. doi: 10.18388/abp.2015_1032.
  18. Bonar Emilia, Wójcik Iwona, Władyka Benedykt. Proteomics in studies of Staphylococcus aureus virulence. Acta Biochim Pol. 2015;62(3):367-81. doi: 10.18388/abp.2015_1083.
  19. Karkowska-Kuleta Justyna., Kozik Andrzej. Moonlighting proteins as virulence factors of pathogenic fungi, parasitic protozoa and multicellular parasites. Mol Oral Microbiol. 2014 Dec;29(6):270-83. doi: 10.1111/omi.12078
  20. Niewiarowska-Sendo Anna (2015): Homo- i heterodimeryzacja receptorów kininowych. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców. Edytor: Kuczera M, Piech K. Zeszyt Nr 4, Tom 1, rozdział: Biologia/Biotechnologia/Zoologia/Rolnictwo, strony: 43-48.
  21. Wielofunkcyjność białek – nowy dogmat czy nadal jedynie kontrowersyjna hipoteza? In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców. Edytor: Kuczera M, Piech K. Zeszyt Nr 1. Tom 3, rozdział: Chemia/Biochemia, strony: 781-786.
  22. Karkowska-Kuleta Justyna, Zając Dorota (2015) Struktura i funkcje macierzy zewnątrzkomórkowej. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców. Edytor: Kuczera M, Piech K.
  23. Szczepionki – nowe metody zwalczania zakażeń grzybiczych. In: Zagadnienia aktualnie poruszane przez młodych naukowców. Edytor: Kuczera M, Piech K. Zeszyt Nr 4, Tom 1, rozdział: Medycyna/Chemia/Żywienie człowieka, strony: 43-48.
  24. Niewiarowska Anna (2014) Etiologia i patogeneza choroby Parkinsona. In: Wpływ Młodych Naukowców na Osiągnięcia Polskiej Nauki, Edytor: Kuczera M, Piech K. Zeszyt Nr 6, Rozdział: Medycyna i żywienie człowieka, strony: 39-47,
  25. Niewiarowska Anna, Muszyńska Klaudia, Patrzałek Katarzyna (2014) Ocena wpływu 17-β-estradiolu na poziom stresu oksydacyjnego w chorobie Parkinsona. In: Dokonania młodych naukowców. Edytor: Kuczera M, Piech K.
  26. Karkowska-Kuleta Justyna, Ostrowska Dominika, Zając Dorota. (2014) Rola kinin produkowanych przez sekrecyjne proteinazy Candida spp. w rozwoju reakcji zapalnej. In: Dokonania młodych naukowców. Edytor: Kuczera M, Piech K. Zeszyt Nr 3, Rozdział: Medycyna i żywienie człowieka, strony: 36-41.

» 2014

1. Ostrowska K, Kazimierska A, Rapala-Kozik Maria, Kalinowska-Tluscik J (2014): Ratiometric fluorescent Zn2+ and In3+ receptors of fused pyrazine with an minopropanol chain in acetonitrile. 38:213-226.

2. Wolak Natalia, Kowalska Ewa, Kozik Andrzej, Rapala-Kozik Maria (2014): Thiamine increases the resistance of baker's yeast Saccharomyces cerevisiae against oxidative, osmotic and thermal stress, through mechanisms partly independent of thiamine diphosphate-bound enzymes. 14:1249-1262.

3. Guevara-Lora Ibeth, Stalinska K, Augustynek Bartłomiej, Labedz-Maslowska A. (2014): Influence of Kinin Peptides on Monocyte-Endothelial Cell Adhesion. 115:1985-1995.

4. Pustelny Katarzyna, Zdzalik M, Stach N, Stec-Niemczyk Justyna, Cichon P, Czarna Anna, Popowicz G, Mak Paweł, Drag M, Salvesen GS, Wladyka Benedykt, Potempa J, Dubin Adam, Dubin G (2014): Staphylococcal SplB serine protease utilizes a novel molecular mechanism of activation. 289(22):15544-53.

5. Pustelny Katarzyna, Stach N, Wladyka Benedykt, Dubin Adam, Dubin G. (2014): Evaluation of P1' substrate specificity of staphylococcal SplB protease. 1(1):149-52.

6. Burchacka E, Zdzalik M, Stec-Niemczyk Justyna, Pustelny Katarzyna, Popowicz G, Władyka Benedykt, Dubin Adam, Potempa J, Sienczyk M, Dubin G, Oleksyszyn J. (2014): Development and binding characteristics of phosphonate inhibitors of SplA protease from Staphylococcus aureus. 23(2):179-89.

7. Sowa-Jasiłek A, Zdybicka-Barabas A, Stączek S, Wydrych J, Mak Paweł, Jakubowicz T, Cytryńska M. (2014): Studies on the role of insect hemolymph polypeptides: Galleria mellonella anionic peptide 2 and lysozyme. 53:194-201.

8. Chmiel E, Palusinska-Szysz M, Zdybicka-Barabas A, Cytryńska M, Mak Paweł. (2014): The effect of Galleria mellonella hemolymph polypeptides on Legionella gormanii. 61(1):123-7.

9. Zdybicka-Barabas A, Mak Paweł, Jakubowicz T, Cytryńska M. (2014): Lysozyme and defense peptides as suppressors of phenoloxidase activity in Galleria mellonella.87(1):1-12.

10. Zdybicka-Barabas A, Palusińska-Szysz M, Gruszecki WI, Mak Paweł, Cytryńska M. (2014): Galleria mellonella apolipophorin III - an apolipoprotein with anti-Legionella pneumophila activity. 1838(10):2689-97.

11. Bukowski Michał, Polakowska K, Ilczyszyn WM, Sitarska Agnieszka, Nytko Kinga, Kosecka M, Miedzobrodzki J, Dubin Adam, Władyka Benedykt. (2014): Species determination within Staphylococcus genus by extender PCR-restriction fragment length polymorphism of saoC gene. 362,1-11.

12. Dziga D, Lisznianska M, Władyka Benedykt. (2014): Bioreactor study employing bacteria with enhanced activity toward cyanobacterial toxins microcystins. 6(8):2379-92.

» 2013

1. Babenko V., Piejko M., Wójcik S., Mak P., Dzwolak W. (2013) Vortex-Induced Amyloid Superstructures of Insulin and Its Component A and B Chains", Langmuir 29, 5271–5278. IF=4.187

2. Bocheńska O., Rąpała-Kozik M., Wolak N., Braś G., Kozik A., Dubin A., Aoki W., Ueda M., Mak P. (2013). Secreted aspartic peptidases of Candida albicans liberate bacterial hemocidins from human hemoglobin. Peptides 45:49-58. IF =2.522

3. Bras G, Bochenska O, Rapala-Kozik M, Guevara-Lora I, Faussner A, Kamysz W, Kozik A.(2013) Release of biologically active kinin peptides, Met-Lys-bradykinin and Leu-Met-Lys-bradykinin from human kininogens by two major secreted aspartic proteases of Candida parapsilosis. Peptides. 48:114-23. IF =2.522

4. Bukowski M., Lyzen R., Helbin WM., Bonar E., Szalewska-Pałasz A., Węgrzyn G., Dubin G., Dubin A., Władyka B.: (2013) A regulatory role for Staphylococcus aureus toxin-antitoxin system PemIKSa. Nature Communiocations: 2013;4:2012. doi: 10.1038/ncomms3012. IF =10.015

5. Dubin, G., Koziel, J., Pyrc, K., Władyka, B., Potempa. J. (2013). Bacterial proteases in disease - role in intracellular survival, evasion of coagulation/fibrinolysis innate defenses, toxicoses and viral infections. Curr. Pharm. Des., 19:1090-1113. IF= 3.311

6. Dziga D, Wasylewski M, Wladyka B, Nybom S, Meriluoto J. (2013) Microbial degradation of microcystins. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):841-52. doi: 10.1021/tx400004; IF =3.667

7. Dziga, D., Sworzen, M., Wladyka, B., Wasylewski, M., 2013. Genetically engineered bacteria immobilized in alginate as an option of cyanotoxins removal. Intern. J. Environ. Sci. Develop. 4, 360-364.

8. Gogól, M. (2013). Citrullination – small change with a great consequence. Folia Biologica et Oecologica, 9(1), 17–25. doi:10.2478/fobio-2013-0003

9. Guevara-Lora I., Blonska B.; Faussner A. Kozik A. (2013). Kinin-generating cellular model obtained from human glioblastoma cell line U-373. Acta Biochim Pol. 2013;60(3):299-305. IF=1.596

10. Karkowska-Kuleta J. (2013) Mechanizmy patogenezy zakażeń wywołanych przez grzyby z rodzaju Candida. Nowe trendy w naukach przyrodniczych. Tom IV. Creative Science – Monografia 2012, str.79-86, pod redakcją Marcina Kuczery, Creativetime, Kraków. ISBN 978-83-63058-25-8

11. Skrzeczynska-Moncznik J, Wlodarczyk A, Banas M, Kwitniewski M, Zabieglo K, Kapinska-Mrowiecka M, Dubin A, Cichy J. (2013) DNA structures decorated with cathepsin G secretory leukocyte proteinase inhibitor stimulate IFNI production by plasmacytoid dendritic cells. Am J Clin Exp Immunol. 2:186-94

12. Wladyka B., Wielebska K., Wloka M., Bochenska O., Dubin G., Dubin A., Mak P. (2013) Isolation, biochemical characterization, and cloning of a bacteriocin from the poultry-associated Staphylococcus aureus strain CH-91. Appl. Microbiol. Biotechnol. 97, 7229–7239. IF = 3.689

13. Zak K., Pecak A., Rys B., Wladyka B., Dömling A., Weber L., Holak TA., Dubin G. (2013) Mdm2 and MdmX inhibitors for the treatment of cancer: a patent review (2011-present). Expert Opin Ther Pat. 2013 Apr;23(4):425-48; PMID: 23374098; IF = 3.53

14. Zawrotniak M, Rapala-Kozik M. (2013) Neutrophil extracellular traps (NETs) - formation and implications. Acta Biochim Pol. 2013;60(3):277-84. IF=1.596

15. Zdybicka-Barabas A., Stączek S., Mak P., Skrzypiec K., Mendyk E., Cytryńska M. (2013) Synergistic action of Galleria mellonella apolipophorin III and lysozyme against Gram-negative bacteria. Biochim. Biophys. Acta - Biomembranes, 1828, 1449–1456. IF=3.919

16. Zdzalik M, Kalinska M, Wysocka M, Stec-Niemczyk J, Cichon P, Stach N, Gruba N, Stennicke HR, Jabaiah A, Markiewicz M, Kedracka-Krok S, Wladyka B, Daugherty PS, Lesner A, Rolka K, Dubin A, Potempa J, Dubin G. (2013) Biochemical and structural characterization of SplD protease from Staphylococcus aureus. PLoS One. 9;8(10):e76812. doi: 10.1371/journal.pone.0076812. eCollection 2013. PubMed PMID:24130791; PubMed Central PMCID: PMC3793935. IF =3.73

» 2012

1. Zdybicka-Barabas A., Straczek S., Mak P., Piersiak T., Skrzypiec K., Cytryńska M. The effect of Galleria mellonella apolipophorin III on yeasts and filamentous fungi. J Insect Physiol. 2012 Jan ;58(1):164-177.

2. Rapala-Kozik M., Wolak N., Kujda M., Banas AK. The upregulation of thiamine (vitamin B1) biosynthesis in Arabidopsis thaliana seedlings under salt and osmotic stress conditions is mediated by abscisic acid at the early stages of this stress response. BMC Plant Biol. 2012 Jan 3;12:2.
3. Kalińska M., Kantyka T., Greenbaum D.C., Larsen K.S., Wladyka B., Jabaiah A., Bogyo M., Daugherty P.S., Wysocka M., Jaros M., Lesner A., Rolka K, Schaschke N., Stennicke H., Dubin A., Potempa J., Dubin G. Substrate specificity of Staphylococcus aureus cysteine proteares - Staphopains A, B and C. Biochimie 2012 Feb;94(2):318-327.
4. Dziga D., Wladyka B., Zielińska G., Meriluoto J., Wasylewski M. Heterologous expression and characterisation of microcysteine. Toxicon. 2012 Apr;59(5):578-586. 
5. Strzalka W., Labecki P., Bartnicki F., Aggarwal C., Rapala-Kozik M., Tani C., Tanaka K., Gabrys H. Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen has several potential sumoylation sites. J Exp Bot. 2012 May;63(8):2971-83.
6. Dziga D., Wasylewski M., Szetela A., Bochenska O., Wladyka B. Verification of the role of MIrC in microcystin biodegradation by studiem Rusing a heterologously expressed enzyme. Chem Res Toxicol. 2012 Jun 18;25(6):1192-1194. 
7. Ostrowska K., Piegza E., Rapala-Kozik M., Stadnicka K. Efficient N-alkyl enamination of 3-(thiobenzoyl)pyrrolo[2,3-b]quinoxalin-2-one, E/Z isomerisation of the reaction products and potential fluorescent sensors for -Zinc(II) ion source. Eur J Org Chem. 2012 July; 19:3636-3646.
8. Guevara-Lora I. Kinin-mediated inflammation in neurodegenerative disorders. Neurochem Int. 2012 Jul;61(1):72-78.
9. Bras G., Bochenska O., Rapala-Kozik M., Guevara-Lora I., Faussner A., Kozik A. Extracellular aspartyl protease SAP2 of Candida albicans yeast cleaves human kininogens and releases proinflammatory peptides, Met-Lys-bradykinin and des-Arg11-Met-Lys-bradykinin. Biol Chem. 2012 Aug;393(8):829-839. 
10. Bista M., Smithson D., Pecak A., Salinas G., Pustelny K., Min J., Pirog A., Finch K., Zdzalik M., Waddell B., Wladyka B., Kedracka-Krok S., Dyer M.A., Dubin G., Guy R.K. On the mechanism of action of SJ-172550 in inhibiting the interaction of MDM4 and p53. PLoS One. 2012;7(6):e37518.
11. Kowalska E., Kujda M., Wolak N., Kozik A. Altered expression and activities of enzymes involved in thiamine diphosphate biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae under oxidative and osmotic stress. FEMS Yeast Res. 2012 Aug;12(5):534-546.
12. Skrzeczyńska-Moncznik J., Wlodarczyk A., Zabieglo K., Karpinska-Mrowiecka M., Marewicz E., Dubin A., Potempa J., Cichy J. Secretory leukocyte proteinase inhibitor -component DNA deposits are potent stimulators of plasmacytoid dendritic cells: Implication for psoriasis. J Immunol. 2012 Aug 15;189(4):1611-1617. 
13. Golebiowski F.M., Górecki A., Bonarek P., Rapala-Kozik M., Kozik A., Dziedzicka-Wasylewska M. An investigation of the affinities, specificity and kinetics involved in the interaction between the Yin Yang 1 transcription factor and DNA. FEBS J. 2012 Sep;279(17):3147-3158.
14. Dubin G., Koziel J., Pyrc K., Wladyka B., Potempa J. Bacterial proteases in disease - role in intracellular survival, evasion of coagulation/fibrinolysis innate defenses, toxicoses and viral infections. Curr Pharm. Des. 2012 Sep 18. 
15. Zdzalik M., Karim A.Y., Wolski K., Buda P., Wojcik K., Brueggemann S., Wojciechowski P., Eick S., Calander A.M., Jonsson I.M., Kubica M., Polakowska K., Miedzobrodzki J., Wladyka B., Potempa J., Dubin G. Prevalence of genes encoding extracellular proteases in Staphylococcus aureus - important targets triggering immune response in vivo. FEMS Immunol Med Microbiol. 2012 Nov;66(2):220-229.
16. Wladyka B., Wielebska K., Wloka M., Bocheńska O., Dubin G., Dubin A., Mak P. Isolation, biochemical characterization and cloning of bacteriocin from the poultry-associated Staphylococcus aureus strain CH91. Appl Microbiol Biotechnol. 2012 Nov 30 DOI 10.1007/s00253-0012-4578-y.
17. Polakowska C., Lis M., Helbin W.M., Dubin G., Dubin A., Niedziołka J., Miedzobrodzki J., Wladyka B. The virulence of Staphylococcus aureus correlates with strain genotype in a chicken embryo model but not a nematode models. Microbes Infect. 2012 Nov;14(14):1352-1362. 
18. Zdybicka-Barabas A., Mak P., Klyś A., Skrzypiec K., Mendyk E., Fiolka M., Cytryńska M. Synergistic action of Galleria mellonella anionic peptide 2 and lysozyme against Gram-negative bacteria. Biochim Biophys Acta. 2012 Nov;1818(11):2623-2635.
19. Palusińska-Szysz M., Zdybicka-Barabas A., Pawlikowska-Pawlęga B., Mak P., Cytryńska M. Anti-Legionella dumoffii activity of Galleria mellonella defensin and apolipophorin III. Int J Mol Sci. 2012 Dec 12;13(12):17048-17064.

» 2011

1. Guevara-Lora I., Labedz A., Skrzeczynska-Moncznik J., Kozik A. (2011) Bradykinin and des-Arg 10-kallidin enhance the adhesion of polymorphonuclear leukocytes to extracellular matrix proteins and endothelial cells. Cell Commun. Adhes. 18, 67-71.

2. Guevara-Lora I., Majkucinska M., Barbasz A., Faussner A., Kozik A. (2011) Kinin generation from exogenous kininogens at the surface of retinoic acid-differentiated human neuroblastoma IMR-32 cells after stimulation with interferon-gamma. Peptides 32, 1193-1200.
3. Karkowska-Kuleta J., Kedracka-Krok S., Rapala-Kozik M., Kamysz W., Bielinska S., Karafova A., Kozik A. (2011) Molecular determinants of the interaction between human high molecular weight kininogen and Candida albicans cell wall: identification of kininogen-binding proteins on fungal cell wall and mapping the cell wall-binding regions on kininogen molecule. Peptides 32, 2488-2496.
4. Koziel J, Karim AY, Przybyszewska K, Ksiazek M, Rapala-Kozik M, Nguyen KA, Potempa J.(2010). Proteolytic inactivation of LL-37 by karilysin, a novel virulence mechanism of Tannerella forsythia. J Innate Immun. 2, 288-293.
5. Kozik A., Golda A., Mak P., Suder P., Silberring J., Barbasz A., Rapala-Kozik M.(2011) Myeloperoxidase-catalyzed oxidative inactivation of human kininogens: the impairment of kinin-precursor and prekallikrein-binding functions. Biol. Chem. 392, 263-274.
6. Kulig P., Kantyka T., Zabel B. A., Chyra A., Stefańska A., Allen S. J., Handel T. M., Kozik.A., Potempa J., Butcher E. C., Cichy J. (2011) Regulation of chemerin chemoattractant and anti-bacterial activity by human cysteine cathepsins. J. Immunol. 187, 1403-1410.
7. Ostrowska K., Szymoniak K, Szczurek M., Jamroży K., Rąpała-Kozik M. (2011) Efficient regioselective heterocyclisation leading to fluorescent fused pyrazine derivatives. Tetrahedron 67, 5219-5227.
8. Rapala-Kozik M., Bras G., Chruscicka B., Krakowska-Kuleta J., Sroka A., Herwald H., Nguyen K-A., Eick S., Potempa J., Kozik A. (2011) Adsorption of components of the plasma kinin-forming system on the surface of Porphyromonas gingivalis involves gingipains as the major docking platforms. Infection and Immunity 79, 797-805.
9. Władyka B, Kozik AJ, Bukowski M, Rojowska A, Kantyka T, Dubin G, Dubin A. (2011). Alpha-1-Antichymotrypsin inactivates staphylococcal cysteine protease in cross-class inhibition. Biochimie, 93: 948-953.
10. Władyka, B., Dubin, G., Dubin, A. (2011) Activation mechanism of thiol protease precursor from broiler chicken specific Staphylococcus aureus strain CH-91. Veterinary Microbiology, 147: 195-199
11. Zdybicka-Barabas A., Januszanis B., Mak P., Cytryńska M. (2011) An atomic force microscopy study of Galleria mellonella apolipophorin III effect on bacteria. Biochim. Biophys. Acta - Biomembranes. 1808, 1896–1906.
12. Bukowski M, Rojowska A, Władyka B. (2011) Prokaryotic toxin-antitoxin systems - the role in bacterial physiology and application in molecular biology. Acta Biochimica Polonica, 58: 1-9.
13. Guevara-Lora I., Gołda A., Kozik A.: Bloting białek. W: Proteomika i metabolomika. Redakcja naukowa: Kraj A., Drabik A., Silberring J. Str.125-138. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa, 2011.
14. Rapala-Kozik M. (2011). Vitamin B1 (Thiamine): A Cofactor for Enzymes Involved in the Main Metabolic Pathways and an Environmental Stress Protectant. Rozdział w książce pt. „Biosynthesis of vitamins in plants. Part A: Vitamins A, B1, B2, B3, B5", pod redakcją F. Rebeille i R. Douce (redaktorzy serii: J.C. Kader i M. Delseny) wydanej przez Elsevier w ramach cyklu wydawniczego: Advances in Botanical Research 58, 37-91.

» 2010

1. Karkowska-Kuleta J., Kozik A., Rapala-Kozik M. (2010) Binding and activation of human plasma kinin-forming system on the cell walls of Candida albicans and Candida tropicalis. Biol. Chem. 391, 97-103 

2. Rapala-Kozik M., Karkowska-Kuleta J., Ryzanowska A., Golda A., Barbasz A., Faussner A., Kozik A. (2010) Degradation of human kininogens with the release of kinin peptides by extracellular proteinases of Candida spp. Biol. Chem. 391, 823-830 
3. Koziel J., Karim A. Y., Przybyszewska K., Ksiazek M., Rapala-Kozik M., Nguyen K-Y., Potempa J. (2010) Proteolytic inactivation of LL-37 by karilysin, a novel virulence mechanism of Tannerella forsythia. J. Inn. Immun. 2, 288-293 
4. Woodward J. B., Abeydeera N. D., Paul D., Phillips K., Rapala-Kozik M., Freeling M., Begley T. P., Ealick S. E., McSteen P., Scanlon M. J. (2010) A maize thiamine auxotroph is defective in shoot meristem maintenance. Plant Cell 22, 3305-3317 
5. Taha H., Skrzypek K., Guevara I., Nigisch A., Mustafa S., Grochot-Przeczek A., Ferdek P., Was H., Kotlinowski J., Kozakowska M., Balcerczyk A., Muchova L., Vitek L., Weigel G., Dulak J., Jozkowicz A. (2010) Role of heme oxygenase-1 in human endothelial cells: lesson from the promoter allelic variants. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 30, 1634-1641 
6. Wybrańska I., Guevara I., Maziarz B., Hartwich J., Kwaśniak M., Iwanejko J., Zdzienicka A., Drożdż R., Kieć-Wilk B., Bodzioch M. et al.: Podstawowe metody stosowane w diagnostyce laboratoryjnej. W: Diagnostyka laboratoryjna z elementami biochemii klinicznej. Podręcznik dla studentów medycyny. Redakcja: Dembińska-Kieć A., Naskalski J. Wydanie III poprawione i uzupełnione. Str. 93-172. Elsevier Urban&Partner, Wrocław 2010. ISBN 978-83-7609-137-2
7. Czarna A., Popowicz G.M., Pecak A., Wolf S., Dubin G., Holak T.A.(2010) High affinity interaction of the p53 peptide-analogue with human Mdm2 and Mdmx. Cell Cycle 8, 1178-1184
8. Mak P., Zdybicka-Barabas A., Cytryńska M. (2010) A different repertoire of Galleria mellonella antimicrobial peptides in larvae challenged with bacteria and fungi. Dev. Comp. Immunol. 34, 1129-36
9. Miedzobrodzki J, Kasprowicz A, Białecka A, Jaworska O, Polakowska K, Władyka B, Dubin A. (2010) The first case of a Staphylococcus pseudintermedius infection after joint prosthesis implantation in a dog. Pol J Microbiol.59, 133-5
10. Zdzalik M, Pustelny K, Kedracka-Krok S, Huben K, Pecak A, Wladyka B, Jankowski S, Dubin A, Potempa J, Dubin G. (2010) Interaction of regulators Mdm2 and Mdmx with transcription factors p53, p63 and p73. Cell Cycle. 9, 4584-91
11. Bukowski M., Władyka B., Dubin G. (2010) Exfoliative Toxins of Staphylococcus aureus. Toxins 2, 1129-36

» 2009

1. Guevara-Lora I., Czosnek C., Smycz A., Janik J.F., Kozik A. (2009) SiC nanoparticles as potential carriers for biologically active substances. J. Phys. Conference Series, 146, 012022

2. Barbasz A., Kozik A.(2009) The assembly and activation of kinin-forming systems on the surface of human U-937 macrophage-like cells. Biol. Chem 390, 269-275
3. Rapala-Kozik M., Gołda A., Kujda M. (2009) Enzymes that control the thiamine diphosphate pool in plant tissues. Properties of thiamine pyrophosphokinase and thiamine-(di)phosphate phosphatase purified from Zea mays seedlings. Plant Physiol. Biochem. 47, 237-242 
4. Czaplicki D., Horwacik I., Kowalczyk A., Wieczorek A., Bolek-Marzec K., Balwierz W., Kozik A., Rokita H.(2009) New method for quantitative analysis of GD2 ganglioside in plasma of neuroblastoma patients. Acta Biochim. Polon. 56, 423-431 
5. Guevara-Lora I., Florkowska M., Kozik A. (2009) Bradykinin-related peptides up-regulate the expression of kinin B1 and B2 receptor genes in human promonocytic cell line U937. Acta Biochim. Polon. 56, 515-522 
6. Bodzon-Kulakowska A., Suder P., Mak P., Bierczynska-Krzysik A., Lubec G., Kotlinska J., Silberring J. (2009) Proteomic analysis of striatal neuronal cell cultures after morphine administration, J. Sep. Sci., 32, 1200-1210
7. Mezyk-Kopec R., Bzowska M., Stalinska K., Chelmicki T., Podkalicki M., Jucha J., Kowalczyk K., Mak P., Bereta J. (2009) Identification of ADAM10 as a major TNF sheddase in ADAM17-deficient fibroblasts. Cytokine 46, 309-315 
8. Suder .P, Bodzon-Kulakowska A., Mak P., Bierczynska-Krzysik A., Daszykowski M., Walczak B., Lubec G., Kotlinska J.H., Silberring J. (2009) The proteomic pnalysis of primary cortical astrocyte cell culture after morphine administration. J. Proteome Res. 8, 4633-4640
9. Stec-Niemczyk J., Pustelny K., Kisielewska M., Bista M., Boulware K.T., Stennicke H.R., Thogerasen I.B., Daugherty P.S., Enghild J.J., Baczyński K., Popowicz G.M., Dubin A,., Potempa J., Dubin G. (2009) Structural and functional chracterization of SplA, an exclusively specific protease of Staphylococus aureus. Biochemical J. 419, 555-564
10. Mickowska B. (2009) Purification and characterization of lapha-proteinase inhibitor and antithrombina III: major serpins of rainbow trout (Oncorhynchuss mykiss) and carp (Cyprius carpio) blood plasma. Fish Physiol Biochem. 35, 231-240
11. Karkowska-Kuleta J., Rąpała-Kozik M., Kozik A. (2009) Fungi pathogenic for humans: insight into molecular bases of Candida albicans, Cryptococcus neoformans and Aspergillus fumigatus virulence. Acta Biochim. Polon. 56, 211-224

» 2008

1. Barbasz A., Guevara-Lora I., Rapala-Kozik M., Kozik A. (2008) Kininogen binding to the surfaces of macrophages. Int. Immunopharmacol. 8, 211-216 

2. Rapala-Kozik M., Karkowska J., Jacher A., Golda A., Barbasz A., Guevara-Lora I., Kozik A. (2008) Kininogen adsorption to the cell surface of Candida spp. Int. Immunopharmacol. 8, 237-241 
3. Rapala-Kozik M., Kowalska E., Ostrowska K. (2008) Modulation of thiamine metabolism in Zea mays seedlings under conditions of abiotic stress. J. Exp. Bot. 59, 4133-4143 
4. Sabat A., Wladyka B., Kosowska-Shick K., Grundmann H., Appelbaum P.C., Kowal J, Dubin A., Hryniewicz W. (2008) Polymorphism, genetic exchange and intragenic recombination of the aureolysin gene among Staphylococcus aureus strains. BMC Microbiology 8, 129-140
5. Władyka B., Bista M., Sabat A.J., Bonar E., Grzeszczuk S., Hryniewicz W., Dubin A. (2008) A novel member of the thermolysis family, clonning aand biochemical chracterisiation of metalloproteoase from Staphylococcus pseudintermedius. Acta Biochim. Polon. 55, 525-536.
6. Dubin G., Stec-Niemczyk J., Kisielewska M., Pustelny K., Popowicz G.M., Bista M., Kantyka T., Boulware K.T., Stennicke H.R., Czarna A., Phopaisarn M., Dauugherty P.S., Thogersen I.B., Enghild J.J., Thornberry N., Dubin A., Potempa J. (2008) Enzymatic activity of the Staphylococcus aureus SplB serine proteinase is induced by substrates containing the sequence Trp-Glu-Leu-Gln. J. Mol. Biol. 379, 343-356.
7. Elas M., Bielanska J., Pustelny K., Plonka P.M., Drelicharz L., Skorka T., Tyrankiewicz U., Wozniak M., Heinze-Paluchowska S., Walski M., Wojnar L., Fortin D., Ventura-Clapier R., Chlopicki S. (2008) Detection of mitochondrial dysfunction by EPR technique in mouse model of dilated cardiomyopathy. Free Radical Biol. & Med. 45,321-328. 
8. Elas M., Bell R., Hleihel D., Barth E.D., McFaul C., Haney C.R., Bielanska J., Pustelny K., Ahn K.H., Pelizzari C.A., Kocherginsky M., Halpern H.J. (2008) Electron paramagnetic resonance oxygen image hypoxic fraction plus radiation dose strongly correlates with tumor cure in FSa fibrosarcomas. Inter. J. Rad. Oncol. Biol. Phys. 71, 542-549. 
9. Wicherek Ł., Mak P., Klimek M. , Banaś T. (2007) The length of menstrual bleeding and the risk of urogenital infections in the context of the activity of hemoglobin-derived microbicidal peptides, Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol., 131, 97-100.
10. Wicherek L., Basta P., Galazka K., Mak P., Dancewicz L., Kalinka J. (2008) RCAS1 decidual immunoreactivity and RCAS1 serum level during cesarean section regarding labor progression. Am. J. Reprod. Immunol., 59, 152-158.
11. Mak P., Maszewska A., Różalska M. (2008) The amino acid sequences and activities of synergistic hemolysins from Staphylococcus cohnii, FEMS Microbiol. Lett. 287, 230-235.
12. Kowalska E., Kozik A. (2008) The genes and enzymes involved in the biosynthesis of thiamin and thiamin diphosphate in yeasts. Cell. Mol. Biol. Lett. 13, 271-282
13. Władyka, B., Pustelny, K. (2008) Regulation of bacterial proteases activity. Cell. Mol. Biol. Lett. 13, 212-229.
14. Mak P. (2008) Hemocidins in a functional and structural context of human antimicrobial peptides. Front. Biosci. 13, 6859-6871. 
15. Guevara-Lora I, Kozik A: Protein blotting. In: Proteomics: Introduction to Methods and Applications. Kraj A., Silberring J., eds., pp. 65-75, John Wiley & Sons, Inc., Hoboken, New Jersey, October 2008
16. Murray R. K., Granner D. K., Rodwell V. W.: Biochemia Harpera, Wyd. VI uaktualnione, redakcja naukowa tłumaczenia: Kokot F., Koj A., Kozik A., Wilczok T., Wydawnictwo Lekarskie PZWL, Warszawa, 2008
17. Mak P.: The physiological importance and the mechanism of action of hemocidins – antibacterial peptides derived from hemoglobin. Rozprawa habilitacyjna, Seria Wydawnicza Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ, 2008.

» 2007

1. Wicherek Ł., Mak P., Klimek M. , Banaś T. (2007) The length of menstrual bleeding and the risk of urogenital infections in the context of the activity of hemoglobin-derived microbicidal peptides, Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol., 131, 97-100.

2. Cytrynska M., Mak P., Zdybicka-Barabas A., Suder P., Jakubowicz T. (2007) Purification and characterization of eight peptides from Galleria mellonella immune hemolymph. Peptides 28, 533-546
3. Dubin, G., Wladyka B., Stec-Niemczyk J., Chmiel D., Zdzalik M., Dubin A., Potempa J. (2007) The staphostatin family of cysteine protease inhibitors in the genus Staphylococcus as an example of parallel evolution of protease and inhibitor specificity. Biol. Chem. 388, 227-235
4. Mak P., Siwek M., Pohl J., Dubin A. (2007) Menstrual hemocidin Hb115-146 is an acidophilic antibacterial peptide potentiating the activity of human defensins, cathelicidin and lysozyme. Am. J. Reprod. Immunol. 57, 81-91
5. Pustelny K., Bielanska J., Plonka P.M., Rosen G.M., Elas M. (2007) In vivo spin trapping of nitric oxide from animal tumors. Nitric oxide 16, 202-208
6. Rapala-Kozik M., Olczak M., Ostrowska K., Starosta A., Kozik A. (2007) Molecular characterization of the thi3 gene involved in thiamine biosynthesis in Zea mays: cDNA sequence and enzymatic and structural properties of the recombinant bifunctional protein with 4-amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine (phosphate) kinase and thiamine monophosphate synthase activities. Biochem. J. 408, 149-159
7. Wicherek Ł., Mak P., Klimek M. , Banaś T. (2007) The length of menstrual bleeding and the risk of urogenital infections in the context of the activity of hemoglobin-derived microbicidal peptides. Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 131, 97-100

» 2006

1. Bierczyńska-Krzysiek A., Bonar E., Drabik A., Noga M., Suder P., Dylag T., Dubin A., Kotlińska J., Silberring J. (2006) Rat brain proteome in morphine dependence. Neurochemistry International 49, 401-406 

2. Bonar E., Dubin A., Bierczynska-Krzysiek A,. Noga M., Silberring J., Stalińska K., Koj A. (2006) Identification of major cellular proteins synthesized in response to interleukin-1 and interleukin-6 in human Hepatoma HepG2 cells. Cytokine 33, 111-117
3. Cytrynska M., Mak P., Zdybicka-Barabas A., Suder P., Jakubowicz T. (2007) Purification and characterization of eight peptides from Galleria mellonella immune hemolymph. Peptides, 28, 533-546 
4. Mak P., Wicherek Ł., Suder P., Dubin A., Banaś T., Kaim I., Klimek M. (2006) Analysis of free hemoglobin level and hemoglobin peptides from human puerperal uterine secretions. J. Soc. Gyn. Invest. 13, 285-291 
5. Popowicz G.M., Dubin G., Steć-Niemczyk, J., Czarny A., Dubin A., Potempa J., Holak T.A. (2006) Functional and structural characterization of Spl proteases from Staphylococcus aureus. J. Mol. Biol. 358, 270-279 
6. Suder P., Bierczynska-Krzysik A., Kraj, Brostedt P., Mak P., Stawikowski M., Rolka K., Nyberg F., Fries E., Silberring J. (2006) Identification of bikunin as an endogenous inhibitor to dynorphin convertase in human cerebrospinal fluid. FEBS Lett., 273, 5113-5120
7. Szyniarowski P., Bettendorff L., Schweingruber E. (2006) The antitrypanosomal drug melarsoprol competitively inhibits thiamin uptake in mouse neuroblastoma cells. Cell Biol. Toxicol. 22, 183-187
8. Węgrzyn P., Jura J., Kupiec T., Piekoszewski W., Władyka B., Zarębski A., Koj A. (2006) A search for gene modulated by uinterleukin-6 alone or with interleukin 1beta in HepG2 cells using differentiated display analysis. Biochim.Biophys. Acta – Mol. Bas. Dis. 1762, 319-328

» 2005

1. Banaś T., Wicherek L., Popiela T.J., Gałązka K., Czekierdowski A., Oudinet J.P., Opławski M., Kulczycka M., Basta A., M. Klimek (2005) Comparative analysis of DFF45 expression between eutopic and ectopic endometrium. Polish Journal of Environmental Studies 14, Suppl II, 429-432 

2. Imamura T., Tanase S., Szmyd G., Kozik A., Travis J., Potempa J. (2005) Induction of vascular leakage through release of bradykinin and a novel kinin by cysteine proteinases from Staphylococcus aureus. J. Exp. Med. 201, 1669-1676 
3. Klimek M, Wicherek L, Galazka K, Tetlak T, Popiela TJ, Kulczycka M, Rudnicka-Sosin L, M. Dutsch-Wicherek (2005) Cycle dependent expression of endometrial metallothionein. Neuroendocrinology Letters 26, 663-666 
4. Mężyk-Kopeć R., Bzowska M., Bzowska M., Mickowska B., Mak P., Potempa J., Bereta J. (2005) Effects of elastase and cathepsin G on the levels of membrane and soluble TNF alpha. Biol. Chem. 386, 801-811 
5. Szyniarowski P., Lakaye B., Czerniecki J., Makarchikow A.F., Wins P., Margineanu I, Coumans B., Grisar T., Bettendorff L. (2005) Pig tissues express a catalytically inefficient 25-kDa thiamine triphosphatase: Insight in the catalytical mechanisms of this enzyme. Biochim. Biophys. Acta – Gen. Subj. 1725, 93-102 
6. Wicherek L., Dutsch-Wicherek M., Mak P., Klimek M. (2005) The role of RCAS1 and oxytocinase in immune tolerance during pregnancy. Fetal Diagnosis and Therapy 20, 420-425 
7. Władyka B., Puzia K., Dubin A. (2005) Efficient co-expression of recombinant staphopain A and its inhibitor staphostatin A in Escherichia coli. Biochem. J. 385, 181-187 
8. Dubin A., Mak P., Dubin G., Rzychoń M., Stec-Niemczyk J., Wladyka B., Maziarka K., Chmiel D. (2005) New generation of peptide antibiotics. Acta Biochimica Polonica 52, 633-638
9. Dubin A.: Research and activities in the protein chemistry laboratory of Jagiellonian University, Faculty of Biotechnology. Biotechnology. Proceedings of the International Review Conference Vienna, November 124-18, 2004. Editor: A.J. Nadolny, Warsaw pp. 134-135, 2005
10. Mickowska B. (2005) Kierunki rozwoju współczesnej biotechnologii. Aura 7, 12-13 
11. Mickowska B. (2005) Klasyfikacja antybiotyków. Aura 11, 22-24
12. Mickowska B. (2005) Molekularne mechanizmy działania antybiotyków. Aura 12, 26-27

» 2004

1. Dubin G., Popowicz G., Krajewski M., Potempa J., Dubin A., Holak T.A. (2004) 1H, 15N and 13C NMR resonance assignments of staphostatin A, a specific Staphylococcus aureus cysteine proteinase inhibitor. J. Biomol. NMR. 28, 295-296.

2. Dubin G., Steć-Niemczyk J., Dylong T., Silberring J., Dubin A., Potempa J. (2004) Characterisation of a highly specific, endogenous inhibitor of cysteine proteinase from Staphylococcus epidermidis, a new member of the staphostatin family. Biol. Chem. 385, 543-546.
3. Dutsch-Wicherek M., Wicherek Ł., Mak P., Składzień J. (2004) Ocena ekspresji RCAS 1 w wybranych stanach chorobowych narządów głowy i szyi. Otorynolaryngologia 3, 25-28.
4. Gołda A., Szyniarowski P., Ostrowska K., Kozik A., Rąpała-Kozik M. (2004) Thiamine binding and metabolism in germinating seeds of selected cereals and legumes. Plant Physiol. Biochem. 42, 187-195.
5. Jura J., Węgrzyn P., Zarębski A., Władyka B., Koj A.(2004) Identification of changes in the transcriptome profile of human hepatoma HepG2 cells stimulated with interleukin-1 beta. Biochim. Biophys. Acta (BBA – Mol. Bas. Dis.) 1689, 120-133.
6. Mak M., Mak P., Olczak M., Szalewicz A., Glogowski J., Dubin A.,Wątorek W., Ciereszko A. (2004) Isolation, characterization and cDNA sequencing of α-1-antiproteinase-like protein from rainbow trout seminal plasma. Biochim. Biophys. Acta (BBA – Gen. Subjects) 1671, 93-105.
7. Mak P., Wójcik K., Wicherek Ł., Suder P., Dubin A. (2004) Antibacterial hemoglobin peptides in human menstrual blood. Peptides 25, 1839-1847.
8. Rzychon M., Chmiel D., Steć-Niemczyk J. (2004) Modes of inhibition of cysteine proteases. Acta Biochim. Polon. 51, 861-873.
9. PROTEOMIKA – praca zbiorowa pod redakcja A. Kraj i J. Silberringa. Wydział Chemii UJ (2004) 1-253
Rozdział 2. Bierczyńska-Krzysik A., Bonar E., Dubin A.: Przygotowanie materiału biologicznego. Str. 13-21
Rozdział 3.2.1. Bierczyńska-Krzysik A., Bonar E., Dubin A.: Elektroforeza jednowymiarowa w żelu poliakrylamidowym. Str. 46-53
Rozdział 3.2.2. Bonar E., Bierczyńska-Krzysik A., Dubin A.: Elektroforeza dwuwymiarowa w żelu polikarylamidowym. Str. 54-62
Rozdział 3.2.4. Kozik A., Guevara-Lora I.: Bloting białek. Str. 64-83
Rozdział 7.2. Rzychoń M.: Proteomika strukturalna. Str. 169-183.

» 2003

1. Dubin G., Krajewski M., Popowicz G., Stec J., Bochtler M., Potempa J., Dubin A., Holak T.A. (2003) Sollution structure of staphostain A from Staphylococcus aureus confirms the discovery of the novel class of cysteine proteinase inhibitors. Biochemistry 42, 13449-13456.

2. Dulinski R., Suder P., Guevara-Lora I., Rapala-Kozik M., Potempa J., Silberring J., Imamura T., Travis J., Kozik A. (2003) Attenuated kinin release from human neutrophil-elastase pretreated kininogens by tissue and plasma kallikreins. Biol. Chem. 384, 929-937.
3. Filipek R., Rzychoń M., Oleksy A., Gruca M., Dubin A., Potempa J., Bochtler M. (2003) The staphostatin-staphopain complex: a forward binding inhibitor in complex with target cysteine protease. J. Biol. Chem. 42, 40959-40966.
4. Mak P., Pohl J., Dubin A., Reed M.S., Bowers S.E., Fallon M.T., Shafer W.M. (2003) The increased bactericidal activity of a fatty acid-modified synthetic antimicrobial peptide of human cathepsin G correlates with its enhanced capacity to interact with model membranes. Int. J. Antimicrobial Agents 21: 13-19.
5. Niziołek M., Kot M., Pyka K., Mak P., Kozik A. (2003) Properties of chemically oxidized kininogens. Acta Biochim. Polonica, 50, 753-763.
6. Olszowski S., Mak P., Olszowska E., Marcinkiewicz J. (2003) Collagen type II modification by hypochlorite. Acta Biochim. Polonica, 50, 471-479.
7. Rapala-Kozik M., Ostrowska K., Bednarczyk K., Dulinski R., Kozik A. (2003) Polypeptide components of oligomeric legumin-like thiamin-binding protein from buckwheat seeds characterized by partial amino acid sequencing and photoaffinity labeling. J. Prot. Chem. 22, 167-175. 
8. Rzychon M., Filipek R., Sabat A., Kosowska K., Dubin A., Potempa J., Bochtler M. (2003) Staphostatins resemble lipocalins, not cystatins in fold. Protein Science 12, 2252-2256.
9. Rzychon M., Sabat A., Kosowska K., Potempa J., Dubin A. (2003 Staphostatin: an expanding new group pf proteinase inhibitors with a unique specificity for the regulkation of staphopains, Sytaphylococcus spp. cysteine proteinases. Mol. Microb. 49,1051-1066.
10. Tomaszewska A., Guevara I., Wilczok T., Dembińska-Kieć A. (2003) 17b-Estradiol- and lipopolysaccharide-induced changes in nitric oxide, tumor necrosis factor-a and vascular endothelial growth factor release from RAW 264.7 macrophages. Gynecol. Obstet. Invest. 56, 152-159. 
11. Wicherek L., Dutsch M., Mak P., Klimek M., Składzień J., Dubin A. (2003) The role of RCAS1 in tumor escape and in immunological tolerance during pregnancy. Acta Biochimica Polonica 50, 1187-1194.
12. Wicherek Ł., Dutsch-Wicherek M., Mak P., Klimek M. (2003) Obecność RCAS1 w ciężarnej macicy chorej na raka jajnika – opis przypadku. Ginekologia Praktyczna, 72, 8-10.
13. Wicherek Ł., Dutsch-Wicherek M., Mak P., Klimek M. (2003) Obecność RCAS1/EBAG9 w łożyskach okołoporodowo. Ginekologia Praktyczna, 74, 20-22.
14. Wojas-Pelc A., Dutsch-Wicherek M., Jaworek A.K., Wicherek Ł., Mak P., Składzień J. (2003) Antygen RCAS1 w rakach podstawnokomórkowych skóry. Przegląd Dermatologiczny, 90, 33-37.
15. Składkowski A.C., Bednarski W., Bielecki J., Bielecki S., Długoński J., Dubin A., Fiedurek J., Gabryś H., Jańska H., Kur J., Skorupska A., Szweykowska-Kulińska Z., Turkiewicz M., Wojtaszek P., Zabża A., Podhajska Z.J. (2003) Kierunki studiów biotechnologicznych w Polsce akredytowane przez Uniwersytecką Komisję Akredydatcyjną (UKA). Biotechnologia 2, 303-315.
16. Wprowadzenie do Chemii Białek. Praca zbiorowa pod redakcją A. Dubin. Seria Wydawnicza WBt UJ 2003, str. 1-204. ISBN 83-88519-38-7.
17. Wybrańska I., Guevara I., Maziarz B., Hartwich J., Kwaśniak M., Iwanejko J., Zdzienicka A., Drożdż R.: Podstawowe techniki i metody stosowane w diagnostyce laboratoryjnej. Rozdz. 5, str. 59-106. W: Diagnostyka laboratoryjna z elementami biochemii klinicznej. Red.: Dembińska-Kieć A., Naskalski J.W. Wydanie II poprawione i uzupełnione. Urban & Partner, Wrocław (ISBN 83-87944-33-5, 997 stron).

» 2002

1. Niedźwiecka A., Marcotrigiano J., Stępinski J., Jankowska-Anyszka M., Wysłouch-Cieszyńska A., Dadlez M., Gingras A.-C. , Mak P., Darzynkiewicz E., Sonenberg N., Burley S.K., Stolarski R. (2002) Biophysical studies of eIF4E cap-binding protein: Recognition of mRNA 5' cap structure and synthetic fragments of eIF4G and 4E-BP1 proteins. J. Mol. Biol. 319, 615-635.

2. Imamura T., Tanase S., Hayashi I., Potempa J., Kozik A., Travis J. (2002) Release of a new vascular permeability enhancing peptide from kininogens by human neutrophil elastase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 294, 423-428.
3. Adamek-Świerczyńska S., Kozik A. (2002) Multiple thiamine-binding proteins of legume seeds. Thiamine-binding vicilin of Vicia faba versus thiamine-binding albumin of Pisum sativum. Plant Physiol. Biochem. 40, 735-741.
4. Chmiel D., Mickowska B. (2002) Systemy regulatorowe agr i sar u Staphylococcus aureus. Post. Biol. Kom. 29, 103-120.

» 2001

1. Mak P., Szewczyk A., Mickowska B., Kicińska A., Dubin A.(2001): Effect of antimicrobial apomyoglobin 56-131 peptide on liposomes and planar lipid bilayer membrane. Intern.J.Antimicrobial Agents 17, 137-142.

2. Banbula A., Yen J., Oleksy A., Mak P., Bugno M., Travis J., Potempa J. (2001) Porphyromonas gingivalis DPP-7 represents a novel type of dipeptidylpeptidase. J. Biol. Chem. 276, 6299-6305
3. Banbula A., Mak P., Smoluch M., Travis J., Potempa J. (2001) Arginine-specific cysteine proteinase from Porphyromonas gingivalis as a convenient tool in protein chemistry, Biol. Chem. 382, 1399-1404
4. Dubin G., Chmiel D., Mak P., Rakwalska M., Rzychoń M., Dubin A. (2001) Molecular Cloning and Biochemical Characterisation of Proteases from Staphylococcus epidermidis. Biol. Chem. 382, 1575-1582
5. Mak P., Chmiel D., Gacek G.J. (2001) Antibacterial peptides of the moth Galleria mellonella. Acta Biochimica Polonica 48,1191-1195.
6. Praktikum z biochemii dla studentów biologii i biotechnologii. Praca zbiorowa pod redakcją A. Dubin i B. Turyny. Seria Wydawnicza IBM UJ Red. Serii A.Dubin. Kraków (2001) wznowienie
7. Analiza instrumentalna w biochemii. Wybrane problemy i metody instrumentalnej biochemii analyticznej. A. Kozik, M. Rąpała-Kozik, I. Guevara-Lora. Seria Wydawnicza IBM UJ Red. Serii A. Dubin. Kraków (2001).
8. Kozik A. (2001) Białko wiążące ryboflawinę z jaj kurzych - struktura białka i mechanizm wiązania ligandu. Post. Biol. Kom. 28 Supl. 16, 183-198.
9. Kotas I. (2001) Biosynteza i bioaktywacja tiaminy. Post.Biol.Kom. 28 Supl.16, 199-212.
10. Boś M. (2001) Hi[potetyczna funkcja tiaminy w układzie nerwowym. Post.Biol.Kom. 28 Supl. 16, 2143-220.
11. Duliński R. (2001) Transport oraz metabolizm tiaminy w komórkach S. cerevisiae. Post.Biol.Kom. 28 Supl. 16, 221-228.
12. Adamek-Świerczyńska S. (2001) Białka transportowe w przestrzeni peryplazmatycznej bakterii gramujemnych. Post.Biol.Kom. 28 Supl. 16, 229-242.
13. Chmiel D. (2001) Mechanizm działania peptydów antybakteryjnych. Post.Biol.Kom. 28 Supl.16, 261-273.
14. Mickowska B. (2001) Peptydy antybakteryjne - struktura i funkcja. Post.Biol.Kom. 28 Supl. 16, (245-259).

» 2000

1. Adamek-Świerczyńska S., Rąpała-Kozik, M., Kozik A. (2000) Purification and preliminary characterisation of a thiamine-binding protein from maize seeds. J. Plant Physiol. 156, 635-639

2. Mickowska B., Duliński R., Kozik A. (2000) Fast, isotope-free methods for the assay of thiamine-binding proteins and for the determination of their affinities to thiamine-related compounds. J. Biochem. Biophys. Methods 44, 95-107
3. Boś M., Kozik A. (2000) Some molecular and enzymatic properties of a homogeneous preparation of thiaminase I purified from carp liver. J. Prot. Chem. 19, 75-84 
4. Mak P., Wójcik K., Silberring J., Dubin A.(2000): Antimicrocial peptides derived from heme-containing proteins: Hemocidins. Antonie van Leeuwenhock 77, 197-207.

» 2000

1. Adamek-Świerczyńska S., Rąpała-Kozik, M., Kozik A. (2000) Purification and preliminary characterisation of a thiamine-binding protein from maize seeds. J. Plant Physiol. 156, 635-639

2. Mickowska B., Duliński R., Kozik A. (2000) Fast, isotope-free methods for the assay of thiamine-binding proteins and for the determination of their affinities to thiamine-related compounds. J. Biochem. Biophys. Methods 44, 95-107
3. Boś M., Kozik A. (2000) Some molecular and enzymatic properties of a homogeneous preparation of thiaminase I purified from carp liver. J. Prot. Chem. 19, 75-84 
4. Mak P., Wójcik K., Silberring J., Dubin A.(2000) Antimicrocial peptides derived from heme-containing proteins: Hemocidins. Antonie van Leeuwenhock 77, 197-207.